Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Proteinlerin Yapı ve İşlevleri
Ders Kodu: ZBY506
Ders Türü: Bölüm Seçmeli
Ders Grubu: Yüksek Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 3
Uyg.: 0
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 8
Amaç

Bu dersin amacı proteinlerin biyokimyasal özelliklerini detaylı bir şekilde öğrenip, yapıları ve fonksiyonları arasındaki ilişkileri atomik düzeyde algılamaları ve atomlar arası fiziksel ve fizikokimyasal ilişkileri proteinin üç boyutlu yapısında görsel ve analitik düzeyde analiz edebilmeleri, proteinlerin yer aldığı tüm biyolojik proseslere atomik düzeyde bakış ve sorunlara çözüm üretme yetilerini arttırmaları, proteinlerin atomik düzeyde algılanması rasyonel farmakolojik etken madde tasarımı gibi kanserden nörolojik hastalıklara kadar bir çok tıp alanında ihtiyaç duyulan yeni nesil ilaçların geliştirilmesi konusunda çalışmak isteyenler için de gerekli teorik ve protaik alt yapının sunulmasıdır.

Özet İçerik

Bu ders kapsamında proteinlerin moleküler düzeyde yapı ve fonksiyonları arasındaki ilişkiler, protein yapısına atomik düzeyde bakış, güncel sorunlara çözüm üretmeye yönelik rasyonel farmakolojik etken madde tasarımları, proteinlerin farklı hiyerarşik yapıları, ve bu yapıların oluşumunda rol alan atom ve gruplar arası fiziksel ve kimyasal bağ ve etkileşimler, mutasyonlar ve mutasyonların görüntülenmesinine yönelik özel uygulamalar hakkında bilgi verilir.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Dr. Öğr. Üyesi Murat Kemal AVCI
Öğrenme Çıktıları
1.Proteinlerin yapıları ve fonksiyonları arasındaki ilişkileri moleküler düzeyde ayırt eder
2.Protein yapısına atomik düzeyde bakış ve sorunlara çözüm üretme yetilerini rasyonel farmakolojik etken madde tasarımı gibi yeni alanlara uygular
3.Proteinlerin farklı hiyerarşik yapılarını kazanmalarında rol alan yer alan atom ve gruplar arası fiziksel ve kimyasal bağ ve etkileşimlerin analizini, mutasyon amaçlı değiştirilmesini ve görüntülenmesini özel programlar (DeepView) kullanarak sağlar ve bu bilgilerini ileride laboratuar deneylerinin ekonomik ve etkin tasarımı için kullanır
4.Protein sentezi konusunda ön bilgi edinirler
5.Protein yapı işlevleri konusunda akademik düzeyde bilgi tarayabilirler
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Protein Structure and Fuction, Petsko G, A and Ringe D; Introduction to protein structure, Branden C; Introduction to Protein Architecture, Lesk A, M; Lehninger Principles of Biochemistry,David L. Nelson, Michael M. Cox. M. Cox
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik
Yapısal Genomik ve Proteomiks
2. Hafta - Teorik
Protein üç boyutlu yapıları; X-Ray ve NMR teknikleri
3. Hafta - Teorik
Proteinlerin üç boyutlu yapılarının görüntülenmesi
4. Hafta - Teorik
Proteinlerin yapı ve mimarileri; Protein katlanması
5. Hafta - Teorik
Proteinlerin hiyaraşik yapıları
6. Hafta - Teorik
Protein işlevlerinin yapısal temelleri.
7. Hafta - Teorik
Protein işlevlerinin kontrolü ve düzenleme mekanizmaları
8. Hafta - Teorik
Amino asit yapısı ve protein fonksiyon ilişkileri
9. Hafta - Teorik
Anahtar motor proteinler. Proteinlerin yıkımı.
10. Hafta - Teorik
Yapısal ve işlevsel genomiks. Homolojiye dayalı modelleme
11. Hafta - Teorik
Yapısal profile dayalı 3-D modellemesi
12. Hafta - Teorik
Ligand bağlama bölgeleri ve katalitik öneme sahip dizileri saptama yöntemleri.
13. Hafta - Teorik
Protein fonksiyonlarının belirlenmesine yönelik teknikler
14. Hafta - Teorik
Füzyon proteinleri
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Ara Sınav (Vize)1%30
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders14103182
Ara Sınav1819
Dönem Sonu Sınavı1819
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)200
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
OÇ-1
5
5
5
4
5
OÇ-2
5
5
4
4
5
OÇ-3
5
5
5
3
5
OÇ-4
4
3
4
3
4
OÇ-5
4
3
2
4
5
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026