Filogenetik sistematiğin temel amaçları şunlardır: (a) organizma gruplarının filogenisini yeniden yapılandırmak ve (b) belirli bir grubun evrimsel tarihi hakkındaki bilgiyi tam olarak yansıtan bir sınıflandırma biçiminde bir bilgi sistemi önermek.

Sistematiğe genel bakış, Temel filogenetik analiz, Moleküler yaklaşımlar, Uygun moleküler markörlerin seçilmesi, moleküler filogenetik