Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
| Ders Kodu | : ZZO631 |
| Ders Türü | : Bölüm Seçmeli |
| Ders Grubu | : Doktora |
| Eğitim Dili | : Türkçe |
| Staj Durumu | : Yok |
| Teori | : 3 |
| Uyg. | : 0 |
| Kredi | : 3 |
| Laboratuvar | : 0 |
| AKTS | : 8 |
Bu dersin amacı; çiftlik hayvanlarında, diğer zirai türlerde ve bunlar dışındaki canlılarda DNA dizi analizleriyle ilgili temel metot ve prensiplerin öğrencilere aktarılmasıdır.
Bu ders kısaca izleyen konuları içermektedir: dizi analizinin tarihsel gelişimi, DNA ve gen yapısı, dizileme için örnek hazırlanması, dizileme metotları (temel metotlar, yeni nesil dizileme yöntemleri ve 3. Nesil DNA dizileme metotları), sekans verilerinin analizi ve yorumlanması, DNA dizi analizinin farklı alanlardaki uygulamaları, vb. konular.
| Prof. Dr. İbrahim CEMAL |
| 1. | DNA dizi analizinin tarihsel gelişiminin öğrenme |
| 2. | DNA'nın nasıl dizilendiğini (sekanslandığını) anlama |
| 3. | DNA’nın nükleotid dizilişinde mevcut kodları anlama |
| 4. | Güncel dizileme teknolojileri ve bunlar arasındaki farklardan haberdar olma |
| 5. | Genlerin kromozomlar üzerindeki dizilimini tanımlayabilme kabiliyetine kavuşma |
| 6. | Hayvan yetiştiriciliği veya diğer zirai bilimlerde DNA dizilim teknolojilerinin uygulama alanlarını öğrenme |
| 1. | Klug, W.S. &Cummings, M.R., 2002. Concepts of Genetics. Sixth edition. Palme Yayıncılık, Ankara. |
| 2. | Munshi, A. (editor) 2012. DNA Sequencing – Methods and Applications. Published by InTech. 184 pages. ISBN 978-953-51-0564-0 |
| 3. | Sun Kim, Haixu Tang, Elaine R. Mardis, editors. 2008. Genome sequencing technology and algorithms [electronic resource]. Boston :Artech House, 259p. |
| 4. | Stuart M. Brown (editor), 2015. Next-Generation DNA Sequencing Informatics. Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 350p, ISBN: 978-1621821236 |
| Değerlendirme Türü | Adet | Yüzde |
|---|---|---|
| Ara Sınav (Vize) | 1 | %30 |
| Dönem Sonu Sınavı (Final) | 1 | %70 |
| Etkinlik | Sayısı | Ön Hazırlık | Süre | Toplam Iş Yükü (Saat) |
|---|---|---|---|---|
| Kuramsal Ders | 12 | 3 | 3 | 72 |
| Ödev | 2 | 15 | 3 | 36 |
| Bireysel Çalışma | 2 | 10 | 0 | 20 |
| Ara Sınav | 1 | 30 | 2 | 32 |
| Dönem Sonu Sınavı | 1 | 36 | 2 | 38 |
| TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat) | 198 | |||
PÇ-1 | PÇ-2 | PÇ-3 | PÇ-4 | PÇ-5 | PÇ-6 | PÇ-7 | PÇ-8 | PÇ-9 | PÇ-10 | |
OÇ-1 | 4 | 1 | 3 | 3 | 2 | 3 | 1 | 3 | ||
OÇ-2 | 3 | 1 | 3 | 3 | 2 | 3 | 1 | 3 | ||
OÇ-3 | 3 | 1 | 2 | |||||||
OÇ-4 | 3 | 2 | 1 | 2 | ||||||
OÇ-5 | 2 | 1 | ||||||||
OÇ-6 | 4 | 3 | 2 | 3 | 4 | 2 | 2 | |||