Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Vektör Genomiği ve Kontrol Stratejileri
Ders Kodu: BYL463
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 1
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 3
Amaç

Bu dersin amacı; halk sağlığını tehdit eden vektör canlıları (sivrisinekler, keneler vb.) ve taşıdıkları patojenleri moleküler, ekolojik ve genomik düzeyde tanıma vizyonu kazandırmaktır. Ders kapsamında; vektörlerin morfolojik ve moleküler teşhis yöntemlerinin teorik ve pratik (laboratuvar) olarak öğretilmesi, kimyasal insektisit direncinin arkasındaki genetik mekanizmaların kavratılması ve popülasyon genetiği temellerinin aktarılması hedeflenmektedir.

Özet İçerik

Vektör genom projeleri, biyoinformatik veritabanları (VectorBase, NCBI), sahadan örnekleme, morfolojik tanı, DNA izolasyonu, PCR ve jel elektroforezi uygulamaları, moleküler teşhis (DNA Barcoding), ELISA, DNA dizi analizleri, Kısır Böcek Tekniği (SIT), RIDL, CRISPR/Cas9 tabanlı gen sürücüleri, bu teknolojilerin ekolojik riskleri ve entegre vektör yönetimi (IVM) stratejileri, vaka analizleri, makale yorumlama

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Vektör kaynaklı hastalıkların küresel önemini açıklayabilir; vektörlerin bağışıklık sistemlerini ve patojenlerle olan moleküler etkileşimlerini tanımlayabilir.
2.Sahadan vektör örnekleme stratejilerini uygulayabilir; stereo mikroskop altında anahtar kullanarak cins düzeyinde ve kısmen tür düzeyinde morfolojik tanı yapabilir ve DNA barcoding (COI/ITS2) yöntemleriyle moleküler teşhis süreçlerini laboratuvarda yürütebilir.
3.VectorBase ve NCBI gibi genomik veritabanlarını kullanarak hedef genleri sorgulayabilir, primer tasarlayabilir ve DNA dizi sonuçlarını mutasyon tespiti için analiz edebilir.
4.Kimyasal kontrol ajanlarına karşı gelişen hedef bölge mutasyonlarını (kdr, Ace-1) ve metabolik detoksifikasyon süreçlerini moleküler düzeyde açıklayabilir; biyolojik ve moleküler direnç testlerini karşılaştırabilir
5.Vektör popülasyonlarındaki gen akışını, genetik sürüklenmeyi ve iklim değişikliğinin bu canlıların coğrafi dağılımları üzerindeki etkilerini yorumlayabilir.
6.Wolbachia tabanlı sitoplazmik uyumsuzluk (IIT), RIDL ve CRISPR/Cas9 tabanlı gen sürücüleri (gene drives) gibi modern biyoteknolojik mücadele yöntemlerinin çalışma prensiplerini açıklayabilir
7.Transgenik ve gen sürücülü böceklerin salınımına bağlı ekolojik riskleri, laboratuvardan kaçış senaryolarını, biyogüvenlik protokollerini ve evrensel etik değerleri eleştirel bir bakış açısıyla değerlendirebilir.
8.Laboratuvarda gerçekleştirdiği DNA izolasyonu, PCR ve jel elektroforezi gibi uygulamalardan elde ettiği bilimsel verileri yorumlayarak Entegre Vektör Yönetimi çerçevesinde somut raporlar veya sunumlar halinde paylaşabilir.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Marquardt, W. C. (2004). Biology of Disease Vectors (2nd ed.). Academic Press
2.Atkinson, P. W. (Ed.). (2012). Vector Biology, Ecology and Control. Springer.
3.World Health Organization. (2017). Global Vector Control Response 2017–2030. WHO Guidelines
4.VectorBase Bioinformatics Database (https://vectorbase.org)
5.NCBI (National Center for Biotechnology Information): https://www.ncbi.nlm.nih.gov
6.Öğretim üyesi tarafından seçilecek iyi kalitede hakemli dergilerde yayınlanmış güncel yayınlar (e.g., Trends in Parasitology, Parasites & Vectors, Insect Molecular Biology).
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik & Uygulama
Vektör Kavramı ve Halk Sağlığı Entomolojisi. Vektör kaynaklı hastalıkların dünyadaki ve Türkiye'deki durumu. Sahadan vektör toplama ekipmanlarının (CDC ışık tuzakları, aspiratörler, kepçeler) tanıtımı ve örnekleme stratejileri
2. Hafta - Teorik & Uygulama
Vektör Genom Projeleri ve Model Organizmalar. Laboratuvarda morfolojik vektör tayini (Stereo mikroskop altında sivrisinek ergin ve larva anahtarlarının kullanımı)
3. Hafta - Teorik & Uygulama
Vektör Biyoinformatiği: VectorBase ve NCBI veritabanlarının kullanımı. VectorBase üzerinden sivrisinek hedef genlerinin (örn: asetilkolinesteraz veya sodyum kanalı genleri) bulunması ve primer tasarımı.
4. Hafta - Teorik & Uygulama
Gen arama ve BLAST süreçleri. Sahadan toplanan veya laboratuvarda üretilen sivrisinek/kene örneklerinden Total DNA İzolasyonu.
5. Hafta - Teorik & Uygulama
Vektörlerin Moleküler Teşhisi (DNA Barcoding). Sıklıkla kullanılan gen bölgeleri (COI, ITS2). İzole edilen DNA'ların kantitatif tayini (Nanodrop) ve COI bölgesi için Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) kurulumu
6. Hafta - Teorik & Uygulama
Vektör-Patojen Etkileşimlerinin Moleküler Temeli. Vektör bağışıklık sistemi yanıtları (Toll, IMD yolakları). Bir önceki hafta yapılan PCR ürünlerinin Agaroz Jel Elektroforezi ile yürütülmesi ve jel görüntüleme sisteminde bant analizi.
7. Hafta - Teorik & Uygulama
İnsektisit Direncinin Moleküler Mekanizmaları (Hedef bölge mutasyonları: kdr ve Ace-1). Geleneksel Biyolojik Direnç Testleri (DSÖ Tüp Testleri / CDC Şişe Testleri) ( (Sözlü sınav)
8. Hafta - Teorik & Uygulama
İnsektisit Direncinin Davranışsal Mekanizmaları. Güncel Makale tartışması (Ara Sınav)
9. Hafta - Teorik & Uygulama
Metabolik Direnç Mekanizmaları. ELISA plak okuyucu yöntemi
10. Hafta - Teorik & Uygulama
Moleküler Sürveyans ve Havuzlanmış Örnek Analizi. Doğadaki vektörlerden patojen tarama stratejileri (Allel spesifik PZR, Multiplex PZR vs). Biyoinformatik: Vektör dizileme sonuçlarının analizi, kromatogram okuma ve mutasyon haritalama
11. Hafta - Teorik & Uygulama
Kısır Böcek Tekniği (SIT) ve Uyumsuz Böcek Tekniği (IIT). Vektör popülasyonlarında Wolbachia varlığının PCR tabanlı yöntemlerle taranması protokolü incelemes
12. Hafta - Teorik & Uygulama
Kısır Böcek Tekniği (SIT) ve Uyumsuz Böcek Tekniği (IIT). Güncel makale tartışması
13. Hafta - Teorik & Uygulama
Kısır Böcek Tekniği (SIT) ve Uyumsuz Böcek Tekniği (IIT). Güncel makale tartışması
14. Hafta - Teorik & Uygulama
CRISPR/Cas9 ve Gen Sürücüleri. Gen sürücülerinin biyogüvenlik riskleri, laboratuvar kaçış senaryoları ve bariyer sistemleri üzerine grup tartışması/vaka analizi, Güncel makale tartışması
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Derse Katılım (Performans)1%5
Sözlü Sınav1%5
Ara Sınav (Vize)1%30
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%60
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders141242
Uygulamalı Ders141128
Ara Sınav1213
Dönem Sonu Sınavı1516
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)79
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
PÇ-11
PÇ-12
PÇ-13
PÇ-14
PÇ-15
OÇ-1
4
4
OÇ-2
5
5
5
OÇ-3
4
5
4
OÇ-4
4
5
4
OÇ-5
4
5
4
OÇ-6
5
5
OÇ-7
4
5
4
5
OÇ-8
4
5
5
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026