Fitopatoloji prensiplerinin, bitki hastalıklarının ve hastalıklara neden olan tüm etkenler ile bunlara karşı yapılacak mücadele ile ilgili temel bilgilerin öğretilmesi bu dersin ana hedefini oluşturmaktadır.

Bitki hastalıklarının tarihçesi, tarımdaki önemi ve bitkide hastalık kavramını içeren bilgiler fitopatoloji dersinin ilk konularını oluşturmaktadır. Takiben hastalık belirtileri anlatılmakta ve bu hastalılara neden olan tüm çevresel faktörler, canlı organizmalar (fungus, bakteri , moliküt, virus, viroid ve parazit bitkiler) ve bunların oluşturduğu bazı hastalıklar örnek verilerek tanıtılmaktadır. Fitopatoloji dersinin son konusu hastalıklarla mücadelede yer alan yöntemler ile ilgili bilgileri içermektedir