Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Bitkiyle İlişkili Olan Fungusların Moleküler Tanılanması ve Filogenetik Analizi
Ders Kodu: ZBK512
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Yüksek Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 2
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 6
Amaç

Bu dersin amacı, bitkiyle ilişkili olan patojen ve yararlı fungusların taksonomik araştırmalarında kullanılan moleküler teknikler hakkında bilgi kazandırmaktır.

Özet İçerik

Bu derste Bitki mikolojisi taksonomisindeki moleküler teknikler, biyolojik mücadele ajanlarının tanılanmasında kullanılan moleküler yenilikler, bitki patojenlerinin tespit ve tanısında moleküler tekniklerin kullanımı, Filogenetik analizler hakkında bilgi verilmektedir.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Mikoloji alanında kullanılan moleküler teknikler hakkında detaylı bilgi kazanır.
2.Bitki fungal patojenlerin ve yararlı mikroorganizmaların tanılanmasında kullanılan moleküler yaklaşımlar hakkında detaylı bilgi sağlar.
3.Fungusların moleküler analiz aşamalarını uygulamalarla DNA ekstraksiyonu, PCR, sekans analiz sonuçlarını değerlendirme gibi pratik beceri edinir.
4.Konukçu bitki-fungal patojen etkileşiminde gerçekleşen moleküler ifadeler hakkında detaylı bilgi sağlar.
5.Filogenetik analiz ile fungusların evrimleşme sürecini kavramasını sağlar.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Gherbawy Y., Voigt K. (2010). Molecular Identification of Fungi. Springer Pres, 522 p.
2.Cumagun, C. J. (Ed.). (2012). Plant Pathology. InTech. 376 p.
3.White TJ, Bruns T, Lee S, Taylor J. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis MA, Gelfand DH, Sninsky JJ, editors. PCR Protocols: a guide to methods and applications. New York: Academic Press; p. 315–322.
4.Gao, C., & Cai, L. (2022). Fungal Taxonomy, Phylogeny, and Ecology: A Themed Issue Dedicated to Academician Wen-Ying Zhuang. Journal of Fungi, 506 p.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik & Uygulama
Moleküler mikolojide örnekleme yöntemleri
2. Hafta - Teorik & Uygulama
Bitki-patojen etkileşiminde moleküler mekanizmalar ve gen ekspresyonu
3. Hafta - Teorik & Uygulama
Moleküler tekniklerin kullanımını sınırlayan faktörler
4. Hafta - Teorik & Uygulama
Funguslarda genomik DNA izolasyonu ve ekstraksiyon yöntemleri
5. Hafta - Teorik & Uygulama
Polimeraz Zincir Reaksiyonun (PCR) temelleri, aşamaları ve uygulamaları
6. Hafta - Teorik & Uygulama
Elektroforezin temelleri ve agaroz jel elektroforezi
7. Hafta - Teorik & Uygulama
Sekans okuma, düzenleme ve analiz programlarının kurulumu ve kullanımı
8. Hafta - Teorik & Uygulama
NCBI GenBank veri tabanının kullanımı ve erişim numarası alınması
9. Hafta - Teorik & Uygulama
Fungal popülasyon genetiğine giriş ve temel moleküler belirteçler
10. Hafta - Teorik & Uygulama
Filogenetik ağaç yapıları ve evrimsel ilişkilerin gösterimi
11. Hafta - Teorik & Uygulama
Filogenetik analizde kullanılan yazılımlar ve araçlar
12. Hafta - Teorik & Uygulama
Çoklu gen veri setlerinin filogenetik analizi
13. Hafta - Teorik & Uygulama
MEGA X programı yardımıyla filogenetik ağaç oluşturma ve yorumlama
14. Hafta - Teorik & Uygulama
Mikoloji alanında gelecekteki moleküler çalışmalara ilişkin genel değerlendirme ve gelecek perspektifleri
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Sunum1%10
Kısa Sınav (Quiz)1%10
Ara Sınav (Vize)1%10
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders142256
Uygulamalı Ders142256
Kısa Sınav1415
Ara Sınav112113
Dönem Sonu Sınavı119120
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)150
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
OÇ-1
5
2
OÇ-2
3
OÇ-3
5
3
5
5
OÇ-4
3
OÇ-5
4
2
4
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026