Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
| Ders Kodu | : ZZO511 |
| Ders Türü | : Bölüm Seçmeli |
| Ders Grubu | : Yüksek Lisans |
| Eğitim Dili | : Türkçe |
| Staj Durumu | : Yok |
| Teori | : 3 |
| Uyg. | : 0 |
| Kredi | : 3 |
| Laboratuvar | : 0 |
| AKTS | : 8 |
Moleküler genetik uygulamalardan elde edilen veri tabanlarının biyoinformatik araçların kullanılması ile analiz edilmesi ve çıktıların değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Ek olarak, dizilerin karşılaştırılması, filogenetik ağaç kurulumu, türler arasındaki uzaklığın hesaplanması, mikroarray verilerinin değerlendirilmesi ve genomik yaklaşımlar bu dersin kapsamındadır.
RAPD, AFLP, RFLP, Mikrosatellitler, SNP, Mikroarray gibi işaretleyiciler kullanılarak elde edilen verilere yönelik analizler
| Doç. Dr. Onur YILMAZ |
| 1. | Biyolojik veri tabanlarının temellerini anlama ve moleküler biyoloji ve genetik kapsamında kullanılabilme |
| 2. | İstatistiksel moleküler genetik parametreler hakkında bilgi sahibi olabilme |
| 3. | Farklı istatistik programlara göre veri setlerinin hazırlanması |
| 4. | Hazırlanan veri setlerinin istatistik programlara tanıtılması |
| 5. | Moleküler genetik veri setlerinin istatistik analizi |
| 1. | Belkhir, K., Borsa, P., Chikhi, L., Raufaste, N., Bonhomme, F., 2001. GENETIX 4.02, logiciel sous Windows TM pour la génétique des populations. Montpellier: Laboratoire Génome, Populations, Interactions, CNRS. Interactions, CNRS, Université de Montpellier II. |
| 2. | Earl, D.A., Vonholdt, B.M., 2012. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method. Conserv Genet Resour 4, 359-361. |
| 3. | Evanno, G., Regnaut, S., Goudet, J., 2005. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study. MolEcol 14, 2611-2620. |
| 4. | Excoffier, L., Lischer, H.E.L., 2010. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol Ecol Resour 10, 564-567. |
| 5. | Falush, D., Stephens, M., Pritchard, J.K., 2003. Inference of population structure using multilocus genotype data: Linked loci and correlated allele frequencies. Genetics 164, 1567-1587 |
| Değerlendirme Türü | Adet | Yüzde |
|---|---|---|
| Ara Sınav (Vize) | 1 | %30 |
| Dönem Sonu Sınavı (Final) | 1 | %70 |
| Etkinlik | Sayısı | Ön Hazırlık | Süre | Toplam Iş Yükü (Saat) |
|---|---|---|---|---|
| Kuramsal Ders | 14 | 3 | 3 | 84 |
| Ödev | 9 | 8 | 1 | 81 |
| Ara Sınav | 1 | 14 | 1 | 15 |
| Dönem Sonu Sınavı | 1 | 14 | 1 | 15 |
| TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat) | 195 | |||
PÇ-1 | PÇ-2 | PÇ-3 | PÇ-4 | PÇ-5 | PÇ-6 | PÇ-7 | |
OÇ-1 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 4 | 4 |
OÇ-2 | 5 | 5 | |||||
OÇ-3 | 4 | 5 | 4 | ||||
OÇ-4 | 4 | 5 | 4 | 5 | 5 | ||
OÇ-5 | 5 | 5 | 5 | 5 | |||