Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Biyoinformatiğe Giriş
Ders Kodu: BYF537
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Yüksek Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 0
Kredi: 2
Laboratuvar: 0
AKTS: 3
Amaç

Bu disiplinler arası ders biyoinformatikin temel kavram ve çeşitli yönleri tanıtır, NCBI veritabanlarını ve araçlarını kullanarak, biyolojik verilerin erişimini, analizini ve yorumlanmalarını yapabilmeyi anlatır

Özet İçerik

Bu disiplinler arası ders biyoinformatikin temel kavram ve çeşitli yönleri tanıtır, NCBI veritabanlarını ve araçlarını kullanarak, biyolojik verilerin erişimini, analizini ve yorumlanmalarını yapabilmeyi anlatır. Dersler dizi analizi, mikrodizi ifade analizi, Bayes yöntemleri, kontrol teorisi, ölçek ücretsiz ağlar ve biyoteknoloji uygulamaları kapsamaktadır. Ders biyoteknolojistlerin yanı sıra bilgisayar ve/veya mühendislik geçmişi olanlar için de faydalı olacaktır.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Biyoinformatik tanımı, önemini ve kullanım alanlarını kavramak
2.Biyoinformatik Veritabanı sistemleri ve web teknolojileri hakkında bilgi sahibi olmak
3.Biyoinformatik yazılım araçları kullanımı hakkında bilgi sahibi olmak
4.Biyoinformatik araştırmalarda kullanılan hizalama yöntemleri hakkında bilgi sahibi olmak
5.Dönem sonunda, disiplinlerarası öğrenciler biyoinformatik ile ilgili temel biyolojik sorular kurgulayabilecek, gerekli veritabanı aramalarını gerçekleştirebilecek, uygun hesaplama araçlarını kullanarak cevaba ulaşabilecek ve bulgularını doğru olarak yorumlayabilecek duruma geleceklerdir
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Biyoinformatiğe giriş, Arthur M. Lesk
2.Biyoinformatiğin temel kavramları, Dan E. Krane, Michael L. Raymer
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik
Biyoinformatik tanımı. Biyoinformatik Önemi
2. Hafta - Teorik
Moleküler Biyolojiye bakış: Hücre, amino asitler, proteinler
3. Hafta - Teorik
Moleküler Biyolojiye bakış:Kromozomlar, DNA, RNA, Genom, Transkriptom, Proteom.
4. Hafta - Teorik
Biyoinformatik Veritabanı sistemleri
5. Hafta - Teorik
Biyoinformatik Veritabanı sistemleri
6. Hafta - Teorik
Biyoinformatik Web Teknolojileri
7. Hafta - Ara Sınav (Vize)
Arasınav
8. Hafta - Teorik
Biyoinformatik Yazılım Araçları
9. Hafta - Teorik
Biyoinformatik Yazılım Araçları
10. Hafta - Teorik
Hizalama yöntemleri (Görsel, Brute Force, Dinamik Programlama, Kelime-Tabanlı).
11. Hafta - Teorik
Nokta Grafıkler, Küresel Hizalama, Yerel Hizalama
12. Hafta - Teorik
Puanlama Matrisleri, Hizalamanın Önemi
13. Hafta - Teorik
Çoklu dizi hizalama. Küresel çoklu hizalama, ilerici küresel hizalama, iteratif yöntemler, yerel korunmuş desenlere dayalı hizalanmalar
14. Hafta - Teorik
Özel genler için veritabanı aramaları
15. Hafta - Dönem Sonu Sınavı (Final)
Final Sınavı
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Sunum1%2.5
Ödev1%2.5
Ara Sınav (Vize)1%25
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders131239
Ödev1213
Sunum1314
Okuma51110
Ara Sınav110212
Dönem Sonu Sınavı110212
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)80
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
PÇ-11
PÇ-12
PÇ-13
PÇ-14
PÇ-15
PÇ-16
PÇ-17
PÇ-18
OÇ-1
5
5
5
5
5
2
3
3
3
5
5
4
4
4
4
3
4
4
OÇ-2
5
5
5
5
5
2
3
3
3
4
5
4
4
4
4
4
4
4
OÇ-3
4
5
4
5
5
2
3
3
3
4
4
4
4
4
4
3
4
4
OÇ-4
5
5
4
5
5
2
3
3
3
4
4
4
4
4
4
3
4
4
OÇ-5
5
5
5
5
5
3
3
3
4
5
5
4
4
4
4
4
4
4
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026