Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
PCR Temelli Polimorfizm Belirleme Uygulamaları
Ders Kodu: ZBY533
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Yüksek Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 2
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 6
Amaç

Öğrencinin DNA'daki bilgiyi deneysel araştırmalarda nasıl kullanacağının öğrenmiş olması amaçlanmaktadır.

Özet İçerik

Polimeraz Zincir Reaksiyonunun geliştirilmesi ile genetik analiz tekniklerinde yeni bir çığır açılmıştır. Bu dersin kapsamında varyasypn kaynakları, polimorfizm ve mutasyon ayrımı, PCR tekniğinin temelleri, basit PCR reaksiyonlarının tasarımı, indirekt mutasyon analiz teknikleri, direkt mutasyon analiz teknikleri, filogenetik ve kimliklendirme çalışmaları için fragment analizleri,gen kopya sayısının ve gen ifadesinin saptanması amacıyla kullanılan eş zamanlı (Real-Time) PCR tekniği anlatılacaktır. Öğrenci bu dersten genom veritabanlarını kullanarak ilgilendiği genlerin lokalizasyon ve yapısını ortaya çıkarmayı, PCR ve/veya Eş zamanlı PCR için primer tasarımı yapabilmeyi, kendi araştırmaları için genetik analiz deneyleri gerektiğinde bu deneyleri tasarımına nereden başlaması gerektiğini öğrenmiş olacaktır.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Öğrenci bu dersten genom veritabanlarını kullanarak genlerin konumlarını bilmeyi öğrenir
2.Öğrenci bu derste Primer tasarlamayı öğrenmiş olacaktır
3.Öğrenci bu derste DNA dizi analizi ve genifadesi belirleme tekniklerini öğrenmiş olacaktır.
4.Eş zamanlı PCR kullanabilecektir.
5.Direk ve indirekt mutasyon yaklaşımlarını öğrenir
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Klug, W. S., Cummings, M. R., Spencer, C. A., Palladino, M. A., & Ward, S. M. (2009). Concepts of genetics (pp. 463-464). Pearson
2.Kwok PY. Methods in Molecular Biology “Single Nucleotide Polymorphisms Methods and Protocols”, 2003, Humana Press
3.O’Connell J. Methods in Molecular Biology “RT-PCR Protocols”, 2002, Humana Press
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik & Uygulama
Genetik analiz deneylerinin tasarımı
2. Hafta - Teorik & Uygulama
Bir genin ekzon ve intron yapısının biyoinformatik araçlarla ortaya çıkarılması
3. Hafta - Teorik & Uygulama
Bir genin ekzon ve intron yapısının biyoinformatik araçlarla ortaya çıkarılması
4. Hafta - Teorik & Uygulama
Primer tasarımı
5. Hafta - Teorik & Uygulama
PCR temelleri
6. Hafta - Teorik & Uygulama
PCR optimizasyonu
7. Hafta - Teorik & Uygulama
Mutasyon ve mutasyon analiz yaklaşımları
8. Hafta - Teorik & Uygulama
Mutasyon ve mutasyon analiz yaklaşımları
9. Hafta - Teorik & Uygulama
Indirekt mutasyon analiz yaklaşımları
10. Hafta - Teorik & Uygulama
Direkt mutasyon analiz yaklaşımları
11. Hafta - Teorik & Uygulama
Biyoinformatik analiz araçları ile dizilerin kıyas ve hizalanmaları
12. Hafta - Teorik & Uygulama
DNA'da tekrar eden diziler ile bunların kimliklendirme ve filogenetik analizlerdeki yerleri
13. Hafta - Teorik & Uygulama
Gen İfade Analizleri
14. Hafta - Teorik & Uygulama
Eş zamanlı PCR: gen kopya sayılarının belirlenmesi
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Ara Sınav (Vize)1%30
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders143270
Uygulamalı Ders142256
Ara Sınav112113
Dönem Sonu Sınavı112113
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)152
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
OÇ-1
3
3
4
5
5
OÇ-2
4
4
5
5
5
OÇ-3
5
4
5
4
5
OÇ-4
4
3
3
5
5
OÇ-5
3
4
4
4
4
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026