Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Proteomik Analizler
Ders Kodu: ZBY537
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Yüksek Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 3
Uyg.: 0
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 6
Amaç

Bu dersin amacı, öğrencilerin Proteomik’in temel kavramlarını öğrenmesini, proteinlerle ilgili analitik düşünceye sahip olabilmesini, proteomun bir hücre veya organizma tarafından belli koşullar altında üretilen proteinler olduğunu, bu moleküllerin birbirleri ile nasıl ilişkilendiğini ve nasıl bir biyolojik sistemi oluşturduğunu ve proteomik uygulamalarının diğer bilim dallarındaki kullanımını öğretmektir

Özet İçerik

Genomikten Proteomiğe Geçiş, Proteinlerin Genel Özellikleri, Proteom analizlerinde kullanılan ayırım teknikleri, Proteinlerin tanımlanmasında kullanılan teknikler, Proteomik ve protein dizilerinin analizi, Yapısal proteom analizleri, Protein-protein etkileşimleri ve proteomik, Proteom analizlerinde protein modifikasyonlarının yeri, Protein çipleri ve fonksiyonel proteom analizleri, Proteomik Uygulamaları

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Proteinlerin birbirleri ile nasıl ilişkilendiğini ve nasıl bir biyolojik sistemi oluşturduğunu anlayabilmesi
2.Proteomun bir hücre veya organizma tarafından belli koşullar altında üretilen proteinler olduğunu öğrenebilmesi
3.Protein ayrımının, tanımlanmasının ve tayin prensiplerinin öğrenilmesi
4.Proteomik ve tarımsal üretimdeki olası rolünün ile bağlantının kurulması
5.Deneysel mantık, analitik düşünce, nicel analiz ve problem çözümü arasındaki bağlantının kurulmasını sağlayabilme
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Principles of Proteomics, RM Twyman, 2014, Garland Science, LCC
2.Proteomik, Münir Tuncer, 2022, Palme Yayınevi
3.Introduction To Proteomics: Principles and Applications -Nawin Mishra, 2010, John Wiley & Sons, Inc
4.Temel ve İleri Moleküler Biyoloji Yöntemleri-Genomik ve Proteomik Analizler. Editörler: Güler Temizkan, Nazlı Arda, 2018, Nobel Tıp Kitabevleri
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik
Genomikten Proteomiğe Geçiş, Proteomik’in faaliyet alanı
2. Hafta - Teorik
Proteinlerin Genel Özellikleri: Proteinlerin yapısı ve işlevi
3. Hafta - Teorik
Proteomik Araçları ve Analitik proteomik
4. Hafta - Teorik
Proteom analizlerindeki elektroforetik ayırım teknikleri: SDS-PAGE ve izoelektrik odaklama
5. Hafta - Teorik
Proteom analizlerindeki elektroforetik ayırım teknikleri: İzoelektrik odaklama
6. Hafta - Teorik
Proteomikte kütle spektrometrisinin kullanımı; kütle spektrometrisi bilgileri kullanılarak protein tanımlanması
7. Hafta - Teorik
Standart iki boyutlu jel ve kütle spektrometrisi ile kantitatif proteomik (Ara Sınav)
8. Hafta - Teorik
Proteom analizlerindeki kromatografik ayırım teknikleri: Yüksek performanslı sıvı kromatografisi
9. Hafta - Teorik
Proteom analizlerindeki kromatografik ayırım teknikleri: Jel filtrasyon kromatografisi
10. Hafta - Teorik
Proteom analizlerindeki kromatografik ayırım teknikleri: İyon değiş-tokuş kromatografisi ve affinite kromatografisi
11. Hafta - Teorik
Protein-protein etkileşimleri ve proteomik: Protein etkileşim analizlerinin prensipleri; Protein etkileşim haritaları
12. Hafta - Teorik
Yapısal proteom analizleri: Protein yapılarının proteomikteki önemi; Protein yapılarının anlaşılmasını sağlayan teknikler; Protein yapılarının karşılaştırılması
13. Hafta - Teorik
Protein çipleri ve fonksiyonel proteom analizleri
14. Hafta - Teorik
Proteomik Uygulama Alanları: Bitkisel proteomik, farmasötik proteomik, hastalık teşhisi, ilaç ve aşı geliştirme
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Ara Sınav (Vize)1%30
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders1473140
Ara Sınav1415
Dönem Sonu Sınavı1415
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)150
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
OÇ-1
5
5
5
5
5
OÇ-2
4
4
4
5
5
OÇ-3
4
4
4
4
5
OÇ-4
4
4
4
4
5
OÇ-5
4
4
4
4
5
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026