Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Genetik Polimorfizm ve Polimorfizm Belirleme Yöntemleri
Ders Kodu: ZBY603
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Doktora
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 2
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 8
Amaç

Öğrencinin DNA'daki varyasyon kaynaklarını bilmesi, varyasyon belirleme bu bilgiyi deneysel araştırmalarda nasıl kullanacağının öğrenmiş olması amaçlanmaktadır.

Özet İçerik

Polimeraz Zincir Reaksiyonunun geliştirilmesi ile genetik analiz tekniklerinde yeni bir çığır açılmıştır. Bu dersin kapsamında varyasypn kaynakları, polimorfizm ve mutasyon ayrımı, PCR tekniğinin temelleri, basit PCR reaksiyonlarının tasarımı, indirekt mutasyon analiz teknikleri, direkt mutasyon analiz teknikleri, filogenetik ve kimliklendirme çalışmaları için fragment analizleri,gen kopya sayısının ve gen ifadesinin saptanması amacıyla kullanılan eş zamanlı (Real-Time) PCR tekniği anlatılacaktır. Öğrenci bu dersten genom veritabanlarını kullanarak ilgilendiği genlerin lokalizasyon ve yapısını ortaya çıkarmayı, PCR ve/veya Eş zamanlı PCR için primer tasarımı yapabilmeyi, kendi araştırmaları için genetik analiz deneyleri gerektiğinde bu deneyleri tasarımına nereden başlaması gerektiğini öğrenmiş olacaktır.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Öğrenci bu dersten genom veritabanlarını kullanarak genlerin konumlarını bilmeyi öğrenir
2.Öğrenci bu derste Primer tasarlamayı öğrenmiş olacaktır
3.Öğrenci bu derste DNA dizi analizi ve genifadesi belirleme tekniklerini öğrenmiş olacaktır
4.Gen ifade analizlerini öğrenir
5.mutasyon analizlerini öğrenir
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Genome: The Autobiography of a Species in 23 Chapters, Matt Ridley
2.GENOMLAR 3, T.A. Brown, Nobel Akademik Yayıncılık
3.Principles of Gene Manipulation and Genomics, 7th Edition. S.B. Primrose and R.M. Twyman. Blackwell Publishing, 2006.
4.Klug, W. S., Cummings, M. R., Spencer, C. A., Palladino, M. A., & Ward, S. M. (2009). Concepts of genetics (pp. 463-464). Pearson
5.Kwok PY. Methods in Molecular Biology “Single Nucleotide Polymorphisms Methods and Protocols”, 2003, Humana Press
6.O’Connell J. Methods in Molecular Biology “RT-PCR Protocols”, 2002, Humana Press
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik & Uygulama
Genetik analiz deneylerinin tasarımı
2. Hafta - Teorik & Uygulama
Bir genin ekzon ve intron yapısının biyoinformatik araçlarla ortaya çıkarılması
3. Hafta - Teorik & Uygulama
Bir genin ekzon ve intron yapısının biyoinformatik araçlarla ortaya çıkarılması
4. Hafta - Teorik & Uygulama
Primer tasarımı (Kısa Sınav)
5. Hafta - Teorik & Uygulama
PCR temelleri
6. Hafta - Teorik & Uygulama
PCR optimizasyonu
7. Hafta - Ara Sınav (Vize)
Ara Sınav
8. Hafta - Teorik & Uygulama
Mutasyon ve mutasyon analiz yaklaşımları
9. Hafta - Teorik & Uygulama
Mutasyon ve mutasyon analiz yaklaşımları
10. Hafta - Teorik & Uygulama
Indirekt mutasyon analiz yaklaşımları
11. Hafta - Teorik & Uygulama
Direkt mutasyon analiz yaklaşımları (Sözlü Sınav)
12. Hafta - Teorik & Uygulama
Biyoinformatik analiz araçları ile dizilerin kıyas ve hizalanmaları
13. Hafta - Teorik & Uygulama
DNA'da tekrar eden diziler ile bunların kimliklendirme ve filogenetik analizlerdeki yerleri
14. Hafta - Teorik & Uygulama
Gen İfade Analizleri, Eş zamanlı PCR: gen kopya sayılarının belirlenmesi
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Kısa Sınav (Quiz)1%10
Sözlü Sınav1%10
Ara Sınav (Vize)1%10
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders144284
Uygulamalı Ders144284
Kısa Sınav1415
Ara Sınav110111
Dönem Sonu Sınavı110111
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)195
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
OÇ-1
5
5
5
5
5
OÇ-2
4
4
4
3
4
OÇ-3
4
3
3
4
4
OÇ-4
4
5
5
3
3
OÇ-5
3
4
4
3
4
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026