Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
| Ders Kodu | : ZBY644 |
| Ders Türü | : Seçmeli |
| Ders Grubu | : Doktora |
| Eğitim Dili | : Türkçe |
| Staj Durumu | : Yok |
| Teori | : 3 |
| Uyg. | : 0 |
| Kredi | : 3 |
| Laboratuvar | : 0 |
| AKTS | : 8 |
Yapısal Genomik ve Proteomiks, Protein üç boyutlu yapıları, X-Ray ve NMR teknikleri, proteinlerin üç boyutlu yapılarının görüntülenmesiyle ilgili program ve uygulamalar, Proteinlerin yapı ve mimarileri, Protein katlanması, Proteinlerin hiyaraşik yapıları, Protein işlevlerinin yapısal temelleri, Protein işlevlerinin kontrolü ve düzenleme mekanizmaları, Anahtar motor proteinler, Proteinlerin yıkımı, Yapısal ve işlevsel genomiks, Homolojiye dayalı modelleme işleyiş konularının incelenmesi
Yapısal Genomik ve Proteomiks, Protein üç boyutlu yapıları, X-Ray ve NMR teknikleri, proteinlerin üç boyutlu yapılarının görüntülenmesiyle ilgili program ve uygulamalar, Proteinlerin yapı ve mimarileri, Protein katlanması, Proteinlerin hiyaraşik yapıları, Protein işlevlerinin yapısal temelleri, Protein işlevlerinin kontrolü ve düzenleme mekanizmaları, Anahtar motor proteinler, Proteinlerin yıkımı, Yapısal ve işlevsel genomiks, Homolojiye dayalı modelleme işleyiş konularının biyoinformatik araçlarla in silico yöntemlerle incelenmesi
| 1. | Proteinlerin yapıları ve fonksiyonları arasındaki ilişkileri moleküler düzeyde ayırt eder. |
| 2. | Protein yapısına atomik düzeyde bakış ve sorunlara çözüm üretme yetilerini rasyonel farmakolojik etken madde tasarımı gibi yeni alanlara uygular |
| 3. | Proteinlerin farklı hiyerarşik yapılarını kazanmalarında rol alan yer alan atom ve gruplar arası fiziksel ve kimyasal bağ ve etkileşimlerin analizini, mutasyon amaçlı değiştirilmesini ve görüntülenmesini özel programlar (DeepView) kullanarak sağlar ve bu bilgilerini ileride laboratuar deneylerinin ekonomik ve etkin tasarımı için kullanır. |
| 4. | Biyoinformatik veritabanları ve araçları öğrenir. İn silico analiz yöntemlerini tecrübe eder |
| 5. | Protein ve gen odaklı biyoinformatik literetürüne hakim olur ve projelendirmeyi öğrenir |
| 1. | Protein Structure and Fuction, Petsko G, A and Ringe D; Introduction to protein structure, Branden C; Introduction to Protein Architecture, Lesk A, M; Lehninger Principles of Biochemistry,David L. Nelson, Michael M. Cox. M. Cox http://structome.org/index.php/Main_Page http://spdbv.vital-it.ch/ http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/index.htm |
| Değerlendirme Türü | Adet | Yüzde |
|---|---|---|
| Ödev | 1 | %5 |
| Kısa Sınav (Quiz) | 1 | %5 |
| Ara Sınav (Vize) | 1 | %20 |
| Dönem Sonu Sınavı (Final) | 1 | %70 |
| Etkinlik | Sayısı | Ön Hazırlık | Süre | Toplam Iş Yükü (Saat) |
|---|---|---|---|---|
| Kuramsal Ders | 14 | 4 | 3 | 98 |
| Ödev | 10 | 3 | 1 | 40 |
| Sunum | 10 | 3 | 1 | 40 |
| Ara Sınav | 1 | 10 | 1 | 11 |
| Dönem Sonu Sınavı | 1 | 10 | 1 | 11 |
| TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat) | 200 | |||
PÇ-1 | PÇ-2 | PÇ-3 | PÇ-4 | PÇ-5 | |
OÇ-1 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 |
OÇ-2 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 |
OÇ-3 | 5 | 4 | 5 | 4 | 4 |
OÇ-4 | 5 | 4 | 5 | 4 | 4 |
OÇ-5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 |