Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Bitkilerde Filogenetik Analiz Metotları I
Ders Kodu: ZBY633
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Doktora
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 3
Uyg.: 0
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 8
Amaç

Bu dersin amacı, Bitkilerde filogenetik sınıflandırmanın amacı, filogenetik sınflandırmada kullanılan sistemler, filogenetik analizin biyoinformatik programlar ile gerçekleştirilmesidir.

Özet İçerik

Bitkilerin sınıflandırılması, bitkilerde kladistik analiz, markır çeşitleri ve filogenetikte kullanımı, monofiletik, polifiletik ve parafiletik sınıflanırılmasının öğrenilmesi.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Bitkilerde sınflandırmanın temel ilkelerinin öğrenilmesi
2.Filogenetiğin temel anlamının öğrenilmesi
3.Kladistik analizin öğrenilmesi
4.Monofiletik, parafiletik ve polifiletik sınıflandırmanın öğrenilmesi
5.Moleküler markır tekniklerinin kullanılmasının öğrenilmesi
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Evolution, Palme Publishing, Lemey, P., Salemi, M., Vandamme, A.M. (2009). The Phylogenetic Handbook. Cambridge University press
2.Nei M, Kumar S (2000) Molecular evolution and phylogenetics. Oxford University press,
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik
Bitkilerin morfolojik özellikleri ve sınıflandırma için kullanımı
2. Hafta - Teorik
Bitkilerin anatomik özellikleri ve sınıflandırma için kullanımı
3. Hafta - Teorik
Bitkilerde morfolojik ve anatomik özellikler kullanılarak karakter tablosu oluşturma
4. Hafta - Teorik
DNA ve RNA’nın yapısı
5. Hafta - Teorik
Bitkilerden genomik DNA izolasyon protokolleri I
6. Hafta - Teorik
Bitkilerden genomik DNA izolasyon protokolleri II
7. Hafta - Teorik
Filogenetiğe giriş
8. Hafta - Teorik
Filogenetiğe giriş (Vize Sınavı)
9. Hafta - Teorik
Bitki filogenetiğine giriş
10. Hafta - Teorik
Filogenetik kavramlar I
11. Hafta - Teorik
Filogenetik kavramlar II
12. Hafta - Teorik
Kladistik analiz ve yorumlanması
13. Hafta - Teorik
Monofiletik, polifiletik parafiletik kavramlar
14. Hafta - Teorik
Bitki filogenetiğinde kullanılan DNA markırları
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Ara Sınav (Vize)1%30
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders14103182
Ara Sınav1819
Dönem Sonu Sınavı1819
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)200
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
OÇ-1
5
4
4
4
4
OÇ-2
4
4
4
4
4
OÇ-3
4
4
4
4
3
OÇ-4
4
4
4
3
3
OÇ-5
5
5
5
5
5
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026