Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
| Ders Kodu | : ZBY616 |
| Ders Türü | : Seçmeli |
| Ders Grubu | : Doktora |
| Eğitim Dili | : Türkçe |
| Staj Durumu | : Yok |
| Teori | : 3 |
| Uyg. | : 0 |
| Kredi | : 3 |
| Laboratuvar | : 0 |
| AKTS | : 8 |
Bu dersin amacı, DNA dizileme ve dizi analiz teknikleri, nrDNA ITS bölgesi, cpDNA trnL-F, matK, psbA-trnH, rpl32-trnL, ndhF, trnQ-rps16, rbcL bölgelerinin öğrenilmesi, PAUP, MEGA 6.0, CLUSTAL, Phylogeny fr., MULTALİN, vb. gibi filogenetik analiz programlarının kullanılması.
DNA dizileme teknikleri ile beraber çekirdek ve kloroplast gen bölgelerinin PCR ile çoğaltılıp biyoinformatik analizi ile filogenetik ağaç elde edilmesi ve yorumlanmasıdır.
| 1. | Filogenetikte kullanılan kodlama yapan ve kodlanmayan gen bölgelerinin öğrenilmesi |
| 2. | Filogenetikte kullanılan çeşitli biyoinformatik bilgisayar programının öğrenilmesi |
| 3. | Biyoinformatik sonuçların değerlendirilmesi |
| 4. | Filogenetik dataların değerlendirilmesinin öğrenilmesi |
| 5. | Filogenetik ağacın yorumlanmasının öğrenilmesi |
| 1. | Evrimsel analiz, Palme Publishing, Nei M, Kumar S (2000) Molecular evolution and phylogenetics. Oxford University press, Lemey, P., Salemi, M., Vandamme, A.M. (2009). The Phylogenetic Handbook. Cambridge University press, Genetic (Nobel Academic Publishing) 2010 |
| 2. | Nei M, Kumar S (2000) Molecular evolution and phylogenetics. Oxford University press, Güler Temizkan and Nazlı Arda, Methods Used in Molecular Biology, Nobel Tıp Kitapevi, İstanbul, 2007, Dale, von Schantz, From Genes to Genomes: Concepts and Applicaitons of DNA Technology, 2nd Edition, John Wiley & Sons, Ltd, USA, 2007 |
| Değerlendirme Türü | Adet | Yüzde |
|---|---|---|
| Ödev | 1 | %5 |
| Kısa Sınav (Quiz) | 1 | %5 |
| Ara Sınav (Vize) | 1 | %20 |
| Dönem Sonu Sınavı (Final) | 1 | %70 |
| Etkinlik | Sayısı | Ön Hazırlık | Süre | Toplam Iş Yükü (Saat) |
|---|---|---|---|---|
| Kuramsal Ders | 14 | 10 | 3 | 182 |
| Ara Sınav | 1 | 8 | 1 | 9 |
| Dönem Sonu Sınavı | 1 | 8 | 1 | 9 |
| TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat) | 200 | |||
PÇ-1 | PÇ-2 | PÇ-3 | PÇ-4 | PÇ-5 | |
OÇ-1 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 |
OÇ-2 | 5 | 5 | 4 | 4 | 4 |
OÇ-3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 |
OÇ-4 | 5 | 4 | 4 | 4 | 5 |
OÇ-5 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 |