Doğru filogenetik çıkarıma ulaşabilmek için gerekli olan uygunbelirteçlerin, özelliklerin, örnekleme büyüklüklerinin ve ağaç oluşturma yöntemlerinin belirlenmesindeki önemli noktaları analiz edebilme becerisinin kazandırılarak öğrencilerin çalışmalarında gerekli olan filogenetik analizleri ve istatistiksel doğrulamalarını kendi alanında geçerli modelleri kullanarak uygulayabilmesi sağlanacaktır.

Evrimin moleküler temeli; protein ve DNA dizilerinde oluşan evrimsel değişiklikler; nükleotidlerdeki sinonimus ve nonsinonimus yer değiştirmeler; filogenetik yakınlıklarda kullanılan metotlar; filogenetik ağaçlar