Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Moleküler Filogenetik
Ders Kodu: ZZO617
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Doktora
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 2
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 8
Amaç

Doğru filogenetik çıkarıma ulaşabilmek için gerekli olan uygunbelirteçlerin, özelliklerin, örnekleme büyüklüklerinin ve ağaç oluşturma yöntemlerinin belirlenmesindeki önemli noktaları analiz edebilme becerisinin kazandırılarak öğrencilerin çalışmalarında gerekli olan filogenetik analizleri ve istatistiksel doğrulamalarını kendi alanında geçerli modelleri kullanarak uygulayabilmesi sağlanacaktır.

Özet İçerik

Evrimin moleküler temeli; protein ve DNA dizilerinde oluşan evrimsel değişiklikler; nükleotidlerdeki sinonimus ve nonsinonimus yer değiştirmeler; filogenetik yakınlıklarda kullanılan metotlar; filogenetik ağaçlar

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Moleküler teknikleri öğrenip, kullanabilmek
2.Filogenetik yöntemleri öğrenmek
3.Filogenetik yakınlıklarda kullanılan metotları öğrenme
4.Filogenetik ağaç oluşturmayı öğrenme.
5.Moleküler verilerden elde edilen filogenetik ağaçlara ilişkin yorum kabiliyetinin kazanılması
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Nei M, Kumar S (2000) Molecular evolution and phylogenetics. Oxford University press.
2.Singh RS, Uyenoyama MK (2004). Evolution of population biology. Cambridge University press.
3.Lemey, P., Salemi, M., Vandamme, A.M. (2009). The Phylogenetic Handbook. Cambridge University press ISBN:9780521877107
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik & Uygulama
Giriş ve Temel Kavramlar
2. Hafta - Teorik & Uygulama
Moleküler Evrim
3. Hafta - Teorik & Uygulama
Genetik Belirteçlerin kullanımı
4. Hafta - Teorik & Uygulama
Filogenetik Ağaçlar ve Temel Terimler
5. Hafta - Teorik & Uygulama
Sekans Verilerinin Toplanması
6. Hafta - Teorik & Uygulama
Hizalama Teknikleri
7. Hafta - Teorik & Uygulama
Model Seçimi ve Filogenetik İnferans
8. Hafta - Teorik & Uygulama
Parsimoni Yöntemi
9. Hafta - Teorik & Uygulama
Maximum Likelihood Yöntemi
10. Hafta - Teorik & Uygulama
Bayesian Filogenetik
11. Hafta - Teorik & Uygulama
Filogenetik Ağaçların Değerlendirilmesi ve Güvenilirlik Analizi
12. Hafta - Teorik & Uygulama
Filogenetik Ağaçların Yorumu ve Uygulamaları
13. Hafta - Teorik & Uygulama
Filogenomik
14. Hafta - Teorik & Uygulama
Özel Konular ve Güncel Araştırmalar
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Ara Sınav (Vize)1%30
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders142256
Uygulamalı Ders140228
Ödev58250
Laboratuvar40312
Ara Sınav120222
Dönem Sonu Sınavı130232
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)200
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
OÇ-1
3
4
3
OÇ-2
4
3
4
OÇ-3
4
3
4
OÇ-4
3
4
4
4
OÇ-5
4
5
3
4
5
3
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026