Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
| Ders Kodu | : MİK668 |
| Ders Türü | : Seçmeli |
| Ders Grubu | : Doktora |
| Eğitim Dili | : Türkçe |
| Staj Durumu | : Yok |
| Teori | : 2 |
| Uyg. | : 2 |
| Kredi | : 3 |
| Laboratuvar | : 0 |
| AKTS | : 4 |
Bu dersin amacı, mikrobiyota ve mikrobiyom ile ilgili temel kavramları, bilgileri ve özel alanları vermektir
Mikrobiyota ve mikrobiyom ile ilgili bilgileri sahaya ve kliniğe aktarabilmek için başından sonuna kadar tüm çalışma aşamalarını bilmek ve uygulamak gerekmektedir. Bu nedenle, mikrobiyota ve mikrobiyomun laboratuvar analizinde kullanılan başlıca yollar; yeni nesil sekans ile mikrobiyom analizi ve laboratuvar aşamaları; hedef gen seçimi, kütüphane oluşturulması, farklı NGS sistemlerine göre aşamalar; biyoinformatik araçların, veri bankalarının kullanımı, verilerin biyoinformatik analizi, filtrelenmesi ve kalite kontrolü; mikrobiyom materyalinin seçimi ve işlenmesi; mikrobiyom verilerinin istatistiksel analizi ve sunumu bu dersin içeriğini oluşturmaktadır.
| 1. | Mikrobiyom analizi için örnekleme ve ön-işleme aşamalarını bilmesi |
| 2. | Mikrobiyom analizi için NGS aşamalarını bilmesi ve uygulayabilmesi |
| 3. | Mikrobiyom analizi için için biyoinformatik araçları bilmesi ve kullanabilmesi |
| 4. | Mikrobiyom verilerini kontrol edip değerlendirebilmesi beklenmektedir |
| 5. | Kendi başına metagenomik analiz yapabilir |
| 1. | Yeni başlayanlar için Metagenomik analiz |
| 2. | Mikrobiyolojide Metagenomik |
| Değerlendirme Türü | Adet | Yüzde |
|---|---|---|
| Derse Katılım (Performans) | 1 | %5 |
| Laboratuvar | 1 | %5 |
| Ara Sınav (Vize) | 1 | %20 |
| Dönem Sonu Sınavı (Final) | 1 | %70 |
| Etkinlik | Sayısı | Ön Hazırlık | Süre | Toplam Iş Yükü (Saat) |
|---|---|---|---|---|
| Kuramsal Ders | 14 | 0 | 2 | 28 |
| Uygulamalı Ders | 14 | 0 | 2 | 28 |
| Laboratuvar | 1 | 15 | 1 | 16 |
| Okuma | 1 | 5 | 2 | 7 |
| Kısa Sınav | 1 | 1 | 1 | 2 |
| Ara Sınav | 1 | 5 | 2 | 7 |
| Dönem Sonu Sınavı | 1 | 10 | 2 | 12 |
| TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat) | 100 | |||
PÇ-1 | PÇ-2 | PÇ-3 | PÇ-4 | PÇ-5 | PÇ-6 | PÇ-7 | |
OÇ-1 | 3 | 5 | 4 | 4 | 4 | 5 | 3 |
OÇ-2 | 5 | 5 | 3 | 4 | 4 | 3 | 4 |
OÇ-3 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 |
OÇ-4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 3 | 3 | 4 |
OÇ-5 | 4 | 5 | 4 | 4 | 4 | 5 | 4 |