Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
| Ders Kodu | : BİS626 |
| Ders Türü | : Seçmeli |
| Ders Grubu | : Doktora |
| Eğitim Dili | : Türkçe |
| Staj Durumu | : Yok |
| Teori | : 3 |
| Uyg. | : 0 |
| Kredi | : 3 |
| Laboratuvar | : 0 |
| AKTS | : 3 |
Hesaplamalı moleküler biyoloji ve biyoinformatikte kullanılan olasılık ve istatistik konuları tanıtmak.
Biyoinformatiğin kısa tarihçesi, Moleküler Biyolojinin temel kavramları, Markov Zincirleri, Tek DNA dizisinin analizi, DNA nın ve DNA daki sinyalin modellenmesi , DNA dizilerini hizalama, dizi benzerliklerini ortaya çıkaran basit testler(BLAST tekniği), İkişerli dizi hizalaması ve dinamik programlama, Entropi ve Entropi ile ilgili kavramlar, Göreli entropi ve bağlanma(binding) enerjisi, Bilinen ve bilinmeyen konumların durumlarını bulma, Dizilerdeki konumun korelasyonu, Gen ifadesi, microarray ve çoklu test, Evrimsel Modeller/ Filogenetik ağaç tahmini.
| 1. | Hesaplamalı moleküler biyoloji ve biyoinformatikte kullanılan olasılık ve istatistik konuları tanımlayabilme. |
| 2. | Biyoinformatikte kullanılan istatistiksel modelleri açıklayabilme ve yorumlayabilme |
| 3. | Olasılık ve istatistik konularını biyoinformatik bilgisayar paketleri ile ilişkilendirebilme |
| 4. | Hesaplamalı biyolojide veri analizi için kullanılan istatistiksel teknikleri geliştirebilme |
| 5. | Veri bankalarındaki çok miktardaki verilerin analizlerine yaklaşımlar sağlamak |
| 1. | Ewens, W. J., & Grant, G. R. (2006). Statistical methods in bioinformatics: an introduction. Springer Science & Business Media. |
| 2. | Lee, J. K. (2011). Statistical bioinformatics: for biomedical and life science researchers. John Wiley & Sons. |
| 3. | Rashidi, H. H., & Buehler, L. K. (1999). Bioinformatics basics: applications in biological science and medicine. CRC press. |
| 4. | Shen, S. (2008). Theory and Mathematical methods in Bioinformatics. Springer Science & Business Media. |
| Değerlendirme Türü | Adet | Yüzde |
|---|---|---|
| Derse Katılım (Performans) | 1 | %5 |
| Ödev | 1 | %5 |
| Ara Sınav (Vize) | 1 | %20 |
| Dönem Sonu Sınavı (Final) | 1 | %70 |
| Etkinlik | Sayısı | Ön Hazırlık | Süre | Toplam Iş Yükü (Saat) |
|---|---|---|---|---|
| Kuramsal Ders | 14 | 0 | 3 | 42 |
| Ara Sınav | 1 | 10 | 1 | 11 |
| Dönem Sonu Sınavı | 1 | 20 | 1 | 21 |
| TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat) | 74 | |||
PÇ-1 | PÇ-2 | PÇ-3 | PÇ-4 | PÇ-5 | PÇ-6 | PÇ-7 | |
OÇ-1 | 4 | 5 | 5 | 4 | 3 | 2 | 3 |
OÇ-2 | 5 | 4 | 5 | 5 | 3 | 2 | 2 |
OÇ-3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 |
OÇ-4 | 5 | 5 | 5 | 4 | 3 | 4 | 4 |
OÇ-5 | |||||||