Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Mikrobiyal Biyofilmler
Ders Kodu: BİO621
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Doktora
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 2
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 8
Amaç

Bu ders öğrencilere, mikroorganizmaların biyofilm yapılarını, bu yapıların incelenmesinde kullanılan kalitatif ve kantitatif metotların öğrenilmesini, biyofilm ile ilgili mekanizmaların kavranmasını, biyofilmlerin çevre ve insan sağlığı açısından önemleri ile biyofilm oluşumunun önlenmesi hakkında bilgi sahibi olunmasını sağlamaktır.

Özet İçerik

Mikrobiyal biyofilm yapısını ve oluşum mekanizması , biyofilm oluşumunun kalitatif ve kantitatif analiz metotları, biyofilm oluşturan mikroorganizmaları önleme metotları, biyofilmin çevrede ve sağlıkta önemi

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Biyofilm tanımını öğrenmek
2.Biyofilm gelişimine neden olan mikroorganizma gruplarını öğrenmek
3.Biyofilmlerin oluşum ve gelişim mekanizmalarını kavramak
4.Biyofilm oluşumunun kalitatif ve kantitatif metotlar ile analizini öğrenmek
5.Biyofilmlerin çevre ve insan sağlığı açısından önemini öğrenmek
6.Mikrobiyal biyofilmlerin biyoteknolojideki önemini anlamak
7.Biyofilm gelişimini önlemede uygulanan metotları kavramak
8.Biyosidal maddelerin biyofilm oluşumuna etkilerini öğrenmek
9.Biyofilm önlemede kullanılabilecek çevre dostu yeni ürünler hakkında bilgi sahibi olmak
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Das S., Kungwani N.A. 2022. Understanding Microbial Biofilms: Fundamentals to Applications. First Edition, Elsevier Science, Amsterdam, Holland, 616p.
2.Abdul B.A.A. 2021. Microbial Biofilms: Properties and Applications in the Environment, Agriculture, and Medicine. First Edition, CRC Press, England, 484p.
3.Ghannoum M., Parsek M., Whiteley M., Mukherjee P.K. 2020. Microbial Biofilms. Second Edition, ASM Press, Washington, USA, 404p.
4.Vickery K. 2020. Microbial Biofilms in Healthcare: Formation, Prevention and Treatment. First Edition, MDPI, Switzerland, 166p.
5.Dincer S., Özdenefe M.S., Arkut A. Bacterial Biofilms. BoD – Books on Demand, Germany, 360p.
6.Seneviratne C.J. 2017. Microbial Biofilms: Omics Biology, Antimicrobials and Clinical Implications. First Edition, CRC Press, England, 290p.
7.Donelli G. 2016. Microbial Biofilms: Methods and Protocols. Second Edition, Springer, New York, USA, 380p.
8.Dhanasekaran D., Thajuddin N. 2016. Microbial Biofilms: Importance and Applications. First Edition, InTech Open, Croatia, 524p.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik
Mikrobiyal biyofilmler tanımı, temel kavramlar ve konuya genel yaklaşım
1. Hafta - Laboratuvar
Laboratuvarda çalışma prensipleri, kimyasal maddelerin kullanımı ve besiortamı hazırlama teknikleri
2. Hafta - Teorik
Mikrobiyal Çeşitlilik (Kültüre Edilebilen ve Edilemeyen Mikroorganizmalar)
2. Hafta - Laboratuvar
Mikroorganizmaların (gıda, toprak, nemli alanlar vb) çeşitli çevrelerden izolasyonu
3. Hafta - Teorik
Mikrobiyal Biyofilm Oluşumu Büyüme, Yapısı ve Gelişim Stratejisi Adhezyonun Fiziko-Kimyasal Yapısı
3. Hafta - Laboratuvar
Mikroorganizmaların (gıda, toprak, nemli alanlar vb) çeşitli çevrelerden izolasyonu
4. Hafta - Teorik
Bakteriyal Biyofilmin Genetiği Quorum Sensing Mekanizması
4. Hafta - Laboratuvar
İzole edilen mikroorganizmaların saflaştırılması ve stoklanması
5. Hafta - Teorik
Biyofilmlerin Ekosistemdeki Fonksiyonu, Mikrobiyal Aktivitenin Yüzeyler Üzerine Etkisi , Biyofilmlerdeki Bakteriyal Metabolizma
5. Hafta - Laboratuvar
İzole edilen mikroorganizmaların saflaştırılması ve stoklanması
6. Hafta - Teorik
Biyofilm Topluluklarının Araştırılmasındaki Moleküler Yöntemler (PCR, Agaroz Jel Elektroforezi, DGGE, FISH)
6. Hafta - Laboratuvar
İzole edilen mikroorganizmaların kalitatif metot ile biyofilm oluşumunun analizi
7. Hafta - Teorik
Biyofilm Modellemesi , Proses Analizi ve Yapısal Bakış Açısı
7. Hafta - Laboratuvar
İzole edilen mikroorganizmaların kalitatif metot ile biyofilm oluşumunun analizi
8. Hafta - Teorik
Konu Tekrarı (Ara sınav)
8. Hafta - Laboratuvar
İzole edilen mikroorganizmaların kalitatif metot ile biyofilm oluşumunun analizi (Ara sınav)
9. Hafta - Teorik
Biyofouling Oluşumunda Biyofilm Gelişimi Örnekleme, Ekstraksiyon ve Moleküler Analiz
9. Hafta - Laboratuvar
Biyofilm oluşturan mikroorganizmalara kantitatif metot uygulanması
10. Hafta - Teorik
Sucul Sistemlerde Biyofilmlere Tutunan Mikroorganizmalar İndikatör ve Patojenik Bakteriler
10. Hafta - Laboratuvar
Biyofilm oluşturan mikroorganizmalara kantitatif metot uygulanması
11. Hafta - Teorik
Biyofilm İnhibitörlerinin Taranması ve İnhibitör Analizleri
11. Hafta - Laboratuvar
Biyofilm oluşturan mikroorganizmalara biyosit ve metallerin uygulanması
12. Hafta - Teorik
Biyosit ve Metaller ile Biyofilm Matriksinin Yıkımı (Metaller ve Biyositler)
12. Hafta - Laboratuvar
Biyofilm oluşturan mikroorganizmalara biyosit ve metallerin uygulanması
13. Hafta - Teorik
Enzimler ile Biyofilm Matriksinin Yıkımı Proteazlar, Glukozidazlar, Lipazlar
13. Hafta - Laboratuvar
Biyofilm oluşturan mikroorganizmalara enzimlerin uygulanması
14. Hafta - Teorik
Biyofilm topluluklarının antibiyotik dirençliliği
14. Hafta - Laboratuvar
Biyofilm oluşturan mikroorganizmalara enzimlerin uygulanması
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Ara Sınav (Vize)1%30
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders142256
Laboratuvar143270
Bireysel Çalışma142370
Ara Sınav1224
Dönem Sonu Sınavı1224
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)204
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
PÇ-11
PÇ-12
PÇ-13
PÇ-14
OÇ-1
4
4
OÇ-2
3
4
4
OÇ-3
4
3
3
4
4
OÇ-4
4
4
4
OÇ-5
4
4
OÇ-6
3
4
OÇ-7
3
3
3
4
OÇ-8
4
4
OÇ-9
4
4
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026