Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Evrimsel ve Ekolojik Genomiks
Ders Kodu: MBTK633
Ders Türü: Bölüm Seçmeli
Ders Grubu: Doktora
Eğitim Dili: İngilizce
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 2
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 7
Amaç

Evrim teorisine moleküler bakış açısı ile irdelemek. Moleküler teknikleri öğrenerek uygun belirteçleri seçmek. Filogeni kavramını öğrenip, çalıştığı organizmaya uygulamak.

Özet İçerik

Evrimin moleküler temeli; protein ve DNA dizilerinde oluşan evrimsel değişiklikler; nükleotidlerdeki sinonim ve sinonim olmayan yer değiştirmeler; filogenetik yakınlıklarda kullanılan metotlar; filogenetik ağaçlar; moleküler saat; nötral allel teorisi

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Moleküler teknikleri öğrenip, kullanabilmek
2.Filogenetik yöntemleri öğrenmek
3.Evrim teorisini moleküler düzeyde hakim olmak
4.DNA'nın yapısını kavramak, mutasyonları inceleyip, çalışmak için uygun araçları tespit etmek
5.Protein ve DNA dizilerinde oluşan evrimsel değişiklikleri bilmek
6.Filogenetik ilişkilerde kullanılan metotları bilir
7.Nötral allel teorisi bilir
8.Filogeni kavramını öğrenmek ve organizmalara uygulamak
9.Nükleotidlerdeki sinonim ve sinonim olmayan yer değiştirmeleri bilir.
10.Filogenetik ağaç oluşturmayı bilir
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Nei M, Kumar S (2000) Molecular evolution and phylogenetics. Oxford University press.
2.Singh RS, Uyenoyama MK (2004). Evolution of population biology. Cambridge University press
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik
Moleküler Ekoloji nedir?
2. Hafta - Teorik
DNA ile ilgili temel bilgiler (Tamiri, replikasyonu, mtDNA vb.)
3. Hafta - Teorik
Moleküler Ekolojide Belirteçler ve Örnekleme
4. Hafta - Teorik
Moleküler evrim, filogenetik
5. Hafta - Teorik
Filocoğrafya
6. Hafta - Uygulama
Maksimum parsimoni, maksimum olasılık ve uzaklık yaklaşımları
7. Hafta - Uygulama
Hardy Weinberg eşitliği, mutasyon, genetik sürüklenme, genetik seçilim
8. Hafta - Uygulama
Hardy Weinberg eşitliği, mutasyon, genetik sürüklenme, genetik seçilim (Ara Sınav)
9. Hafta - Uygulama
Nötral teori, popülasyon çeşitlilik kaynakları
10. Hafta - Uygulama
Populasyonların genetik yapılarının belirlenmesi
11. Hafta - Teorik
Türleşme ve Hibritleşme
12. Hafta - Teorik
Koruma Genetiği
13. Hafta - Uygulama
Örnek Çalışmalar
14. Hafta - Uygulama
Veri Analiz Paket Programları
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Ara Sınav (Vize)1%30
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders140228
Uygulamalı Ders140228
Ödev301236
Dönem Ödevi30618
Bireysel Çalışma130339
Kısa Sınav60318
Ara Sınav1033
Dönem Sonu Sınavı1033
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)173
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
PÇ-11
PÇ-12
PÇ-13
OÇ-1
5
5
3
5
5
3
4
4
4
4
3
3
5
OÇ-2
5
5
3
5
5
3
4
4
4
4
3
3
5
OÇ-3
5
5
3
4
4
3
5
5
5
5
3
3
5
OÇ-4
5
5
3
4
4
3
5
5
5
5
3
3
5
OÇ-5
5
5
3
4
4
3
5
5
5
5
3
3
5
OÇ-6
5
5
3
4
4
3
5
5
5
5
3
3
5
OÇ-7
5
5
3
4
4
3
5
5
5
5
3
3
5
OÇ-8
5
5
3
4
4
3
5
5
5
5
3
3
5
OÇ-9
5
5
3
4
4
3
5
5
5
5
3
3
5
OÇ-10
5
5
3
4
4
3
5
5
5
5
3
3
5
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu