Ders Kodu | : MBTK643 |
Ders Türü | : Bölüm Seçmeli |
Ders Grubu | : Doktora |
Eğitim Dili | : İngilizce |
Staj Durumu | : Yok |
Teori | : 3 |
Uyg. | : 0 |
Kredi | : 3 |
Laboratuvar | : 0 |
AKTS | : 10 |
Bu dersin amacı kompleks biyolojik sistemlerin analizi, nükleik asit ve protein dizi analizlerinin temellerini biyoinformatik araçlar kullanılarak uygulamalı olarak öğrencilerin öğrenmesini sağlamaktır
Genomiks, GenBank Dizi Data bankası, Dizi Birleştirme, Gen Tahmini konuları ve ilgili Programlar (NCBI's Entrez, BLAST, PSI-BLAST, ClustalW, Pfam, BIOEDIT, GENEMARKER, SEQUIN, CAP3, ORF FINDER, GENSCAN, MICROSATELLITE REPEATS FINDER)
Prof. Dr. Gamze BAŞBÜLBÜL |
1. | Bu dersin sonunda öğrenciler, Sayısal Biyoloji ve Biyoinformatik hakkında temel kavramları öğrenir |
2. | Öğrenciler sekans analiz yöntemlerini belirleyebilecektir |
3. | Öğrenciler sekans analizinin farklı uygulama alanlarına uygulayabileceklerdir |
4. | Öğrenciler en yaygın kullanılan biyoinformatik programlarının kullanım alanları ve detayları hakkında bilgi sahibi olur |
5. | Öğrenciler en önemli biyoinformatik programlarının kullanım tecrübesi edinir |
6. | Öğrenciler sekans analiz sonuçlarını yorumlayabilirler |
1. | Bioinformatics, A practical Guide to the Analysis of Genes and proteins, A.D. Baxevanis ve B.F.F. Ouellette, 1998, ISBN0-471-19196-5 |
Değerlendirme Türü | Adet | Yüzde |
---|---|---|
Ara Sınav (Vize) | 1 | %30 |
Dönem Sonu Sınavı (Final) | 1 | %70 |
Etkinlik | Sayısı | Ön Hazırlık | Süre | Toplam Iş Yükü (Saat) |
---|---|---|---|---|
Kuramsal Ders | 14 | 0 | 3 | 42 |
Ödev | 5 | 0 | 15 | 75 |
Dönem Ödevi | 3 | 0 | 6 | 18 |
Laboratuvar | 5 | 0 | 4 | 20 |
Bireysel Çalışma | 13 | 0 | 5 | 65 |
Kısa Sınav | 6 | 0 | 3 | 18 |
Ara Sınav | 1 | 0 | 3 | 3 |
Dönem Sonu Sınavı | 1 | 0 | 3 | 3 |
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat) | 244 |
PÇ-1 | PÇ-2 | PÇ-3 | PÇ-4 | PÇ-5 | PÇ-6 | PÇ-7 | PÇ-8 | PÇ-9 | PÇ-10 | PÇ-11 | PÇ-12 | PÇ-13 | |
OÇ-1 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 3 | 5 |
OÇ-2 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 3 | 5 |
OÇ-3 | 5 | 5 | 3 | 4 | 4 | 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 3 | 5 |
OÇ-4 | 5 | 5 | 3 | 4 | 4 | 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 3 | 5 |
OÇ-5 | 5 | 5 | 3 | 4 | 4 | 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 3 | 5 |
OÇ-6 | 5 | 5 | 3 | 4 | 4 | 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 3 | 5 |