Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Kanser Genomu ve Kanser Genom Projesi
Ders Kodu: ONK614
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Doktora
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 2
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 8
Amaç

Bu dersin amacı kanser genomunun önemini kavratmak ve kanser genom projesinin kanser tedavisindeki yerini öğretmektir.

Özet İçerik

Kanser Genomundaki Somatik Mutasyonlar, Sürücü ve Yolcu Mutasyonlar (Driver and Passanger Mutation), Kanser Genomunun Dizilenmesi, Kanser Genom Atlası (TCGA) gibi konular işlenecektir.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Kanser genomu kavramını açıklar.
2.Kanserde bulunan mutasyonları bilir.
3.RNA ve DNA dizilimini öğrenir.
4.Kanser genom projesi hakkında fikir sahibi olur.
5.Kanser genomunun ve kanser genom projesinin kliniğe yansımasını irdeler.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Cancer Genomics: From Bench to Personalized Medicine 1st Edition, Graham Dellaire, Academic Press, 2013, ISBN 978-0123969675
2.Cancer Genetics and Genomics for Personalized Medicine 1st Edition, Il-Jin Kim, Jenny Stanford Publishing, 2017, ISBN 978-9814669870
3.Basic and Clinical İmmunology. 6th ed. Eds.Stides, Stobo, Wells. Connecticut USA.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik & Uygulama
Kanser Genomuna Giriş
2. Hafta - Teorik & Uygulama
Kanser Genomundaki Somatik Mutasyonlar
3. Hafta - Teorik & Uygulama
Sonradan Kazanılan Mutasyonlar
4. Hafta - Teorik & Uygulama
Sürücü ve Yolcu Mutasyonlar (Driver and Passanger Mutation)
5. Hafta - Teorik & Uygulama
Kanser Genomunun Dizilenmesi
6. Hafta - Teorik & Uygulama
RNA ve miRNA Dizileme (RNAseq and miRNAseq)
7. Hafta - Teorik & Uygulama
DNA Dizileme (DNAseq)-1
8. Hafta - Teorik & Uygulama
DNA Dizileme (DNAseq)-2 (Ara Sınav)
9. Hafta - Teorik & Uygulama
SNP-bazlı Platformlar ve DNA metilasyon Dizileme
10. Hafta - Teorik & Uygulama
Diğer platformlar (Gen ifadesi, ekzon ifadesi, miRNA ifadesi, protein ifadeleri, CNV, SNP, LOH,)
11. Hafta - Teorik & Uygulama
Genomik verilerin görselleştirilmesi ve analizi
12. Hafta - Teorik & Uygulama
Kanser Genom Atlası (TCGA)
13. Hafta - Teorik & Uygulama
Kanser Genom Atlası Verileriyle Yapılan Keşifler ve Kliniğe Yansıması (Glioblastom, Akciğer Adenokarsinom, Meme Kanseri, Kolorektal Kanser, AML, Gastrik Karsinom vb)
14. Hafta - Teorik & Uygulama
Pan-Kanser Projesi
15. Hafta - Dönem Sonu Sınavı (Final)
Final Sınavı
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Ödev1%5
Kısa Sınav (Quiz)1%5
Ara Sınav (Vize)1%20
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders141242
Uygulamalı Ders141242
Ödev124024
Kısa Sınav112113
Ara Sınav124226
Dönem Sonu Sınavı148250
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)197
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
PÇ-11
PÇ-12
PÇ-13
PÇ-14
PÇ-15
OÇ-1
5
5
5
5
4
4
4
4
5
5
5
5
5
5
5
OÇ-2
5
5
5
5
4
5
4
4
4
5
5
5
5
5
5
OÇ-3
5
5
5
5
4
4
4
4
5
5
5
5
5
5
5
OÇ-4
5
5
5
5
4
4
4
4
5
5
5
5
5
5
5
OÇ-5
5
5
5
5
4
4
4
4
5
5
5
5
5
5
5
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026