Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Kanserde Biyoinformatik
Ders Kodu: ONK537
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Yüksek Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 1
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 7
Amaç

Biyoinformatik araçlar ve teknikler hakkında bilgi sahibi olmaları, teknolojilerden nasıl yararlanabileceğini bilmeleri, veri bankalarına bağlanmayı ve bu alandaki biyoinformatik değerlendirmelerini bilmelerini sağlamaktır.

Özet İçerik

Biyoinformatiğe giriş, biyoinformatik teknikleri, onkolojik araştırmalarda biyoinformatiğin kullanımı gibi konularda bilgi verilecektir.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Biyoinformatik bilgilerin önemi ve kullanım alanının kavratılması
2.Biyoinformatik veritabanların öğrenilmesi
3.Veritabanları üzerinden işlem yapılması ve veri elde edilmesinin kavratılması
4.Protein yapıları kavranarak bu verilerden analizler yapabilme becerisini kazanmak
5.Karşılaştırmalı genom analizleri yapabilecek becerilere sahip olmak
6.Kanser araştırmalarında biyoinformatik yöntemler hakkında bilgi sahibidir.
7.In silico çalışmaları literatürde izler ve kavrar.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Introduction to Bioinformatics, Anna Tramontano, Chapman and Hall/CRC, 2018, ISBN 9781351989411
2.Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis, David Mount, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2004, ISBN 978-0879697129
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik & Uygulama
Biyoinformatiğe Giriş
2. Hafta - Teorik & Uygulama
Biyoinformatiğin Temelleri
3. Hafta - Teorik & Uygulama
Biyoinformatik araçlar ve teknikler
4. Hafta - Teorik & Uygulama
Biyoinformatikte bilginin toplanması ve işlenmesi
5. Hafta - Teorik & Uygulama
Veri bankaları oluşturma ve veri bankalarının kullanımı
6. Hafta - Teorik & Uygulama
NCBI Veritabanı ve GenBank Veri Analizi
7. Hafta - Teorik & Uygulama
Nükleotid ve Aminoasit Dizilimlerinin Veritabanlarına Sunulması
8. Hafta - Teorik & Uygulama
Sekans Verilerinin Karşılaştırılması ve Analizi (Ara sınav)
9. Hafta - Teorik & Uygulama
Protein Veritabanları, Protein Verilerinin Karşılaştırılması ve Analizi
10. Hafta - Teorik & Uygulama
ESTs Analizi, Gen Tahmini ve Regülasyonu
11. Hafta - Teorik & Uygulama
Filogenetik Analizler
12. Hafta - Teorik & Uygulama
Karşılaştırmalı Genom Analizi
13. Hafta - Teorik & Uygulama
Onkolojide Biyoinformatik
14. Hafta - Teorik & Uygulama
Kanser araştırmalarında biyoinformatik araçlarının kullanımı, Kanser Genom Projesi, Genomik, epigenomik, transkriptomik ve proteomik veriler, Biyoinformatiğin kanser teşhis ve tedavisindeki yeri ve önemi
15. Hafta - Dönem Sonu Sınavı (Final)
Final sınavı
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Ödev1%5
Kısa Sınav (Quiz)1%5
Ara Sınav (Vize)1%20
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders141242
Uygulamalı Ders141128
Ödev118119
Kısa Sınav1819
Ara Sınav124226
Dönem Sonu Sınavı148250
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)174
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
PÇ-11
PÇ-12
PÇ-13
PÇ-14
OÇ-1
3
3
5
4
2
5
2
4
3
2
4
4
2
2
OÇ-2
3
3
5
4
2
5
2
4
3
2
4
4
2
2
OÇ-3
3
3
5
4
2
5
2
4
3
2
4
4
2
2
OÇ-4
3
3
5
4
2
5
2
4
3
2
4
4
2
2
OÇ-5
3
3
5
4
2
5
2
4
3
2
4
4
2
2
OÇ-6
3
3
5
4
2
5
2
4
3
2
4
4
2
2
OÇ-7
3
3
5
4
2
5
2
4
3
2
4
4
2
2
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026