Tarımsal biyoteknoloji alanında karşılaşılan problemlere yönelik mühendislik tasarım yaklaşımını kazandırmak; biyolojik sistemler, biyoprosesler ve biyoteknolojik ürünlerin tasarımında bilimsel, teknik, ekonomik, çevresel, etik ve sürdürülebilirlik ilkelerini dikkate alarak çözüm geliştirme becerisi kazandırmaktır. Ders kapsamında öğrencilerin gerçek yaşam problemlerini analiz etmesi, tasarım kriterleri oluşturması, alternatif çözümler geliştirmesi, prototip veya süreç tasarımı planlaması ve sonuçlarını teknik olarak değerlendirmesi hedeflenmektedir.

Mühendislik tasarım sürecinin temel ilkeleri; tarımsal biyoteknolojide problem tanımlama ve ihtiyaç analizi; tasarım kriterleri ve kısıtlarının belirlenmesi; biyoteknolojik ürün, proses ve sistem tasarımı; biyoproses optimizasyonu; laboratuvardan endüstriye ölçek büyütme (scale-up) yaklaşımları; kalite yönetimi ve risk analizi; ekonomik fizibilite, çevresel etkiler, sürdürülebilirlik ve etik değerlendirmeler; fikri mülkiyet hakları; proje tabanlı tasarım uygulamaları, teknik rapor hazırlama ve tasarım sunumları.