Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Moleküler Markırlar ve Analiz Yöntemleri
Ders Kodu: TBY410
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 0
Kredi: 3
Laboratuvar: 1
AKTS: 4
Amaç

Dersin amacı, Markörlerin tanımı, Morfolojik, Biyokimyasal ve DNA tabanlı markörlerin öğretilmesidir. Prokaryotik canlılarda ki moleküler tanı, Ökaryoyik canlılarda çekirdek, kloroplast ve mitokondri gen bölgelerinin öğrenilmesi, ve biyoinformatik araçlar ile filogenetik analizde kullanılması amaçlanmıştır.

Özet İçerik

Markörlerin tanımı, Morfolojik, Biyokimyasal ve DNA tabanlı markörlerin tarımda kullanımı, Ökaryotik ve Prokaryotik canlılarda moleküler tanı, gen bölgelerinin öğremilmesi, Filogenetik analiz metotlar ve kullanılan biyoinformatik araçların öğrenilmesidir.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Markör tanımının öğretilmesi
2.Moleküler markörlerin avantaj ve dezavantajlarını öğrenme
3.Moleküler markörlerin tarımda, ıslah programlarında kullanımını öğrenme
4.Hedefe uygun yöntem ve marker seçimi yapabilme bilgisine sahip olma
5.Prokaryotlarda ve Ökaryotlarda moleküler tanı bilgisine sahip olma
6.Filogenetik analiz metotlarını bilme
7.Biyoinformatik metotları öğrenebilme ve kullanabilme
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Nathan, S. Moiser, Michael R. Ladisch. 2009. Modern Biotechnology
2.Bitki Biyoteknolojisi (Genetik Mühendisliği ve Uygulamaları) Sebahattin Özcan, Ekrem Gürel, Mehmet Babaoğlu. Selçuk Üniversitesi Vakfı Yayınları.
3.Moleküler genetiğin esasları, Doç. Dr. H. Ümit LÜLEYAP, Nobel Kitapevi, 2008
4.Moleküler Biyoloji, Nobel Akademik Yayıncılık Danışmanlık Tic. Prof. Dr. Mehmet KARATAŞ, 2012
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik
Markör nedir, Morfolojik, ve biyokimyasal markörler
1. Hafta - Laboratuvar
Elektroforez teknikleri
1. Hafta - Ön Hazırlık
Tüm haftalık konuların gösterilmesi
2. Hafta - Teorik
PCR yöntemi, DNA tabanlı markörlere giriş
2. Hafta - Laboratuvar
PCR uygulaması
3. Hafta - Teorik
RFLP ve RAPD tekniği
3. Hafta - Laboratuvar
RAPD ve RFLP tekniğinin uygulanması
4. Hafta - Teorik
ISSR ve AFLP tekniği
4. Hafta - Laboratuvar
ISSR ve AFLP tekniğinin uygulanması
5. Hafta - Teorik
SSR, VNTR, SNP markör tekniği
5. Hafta - Laboratuvar
SSR, VNTR, SNP tekniğinin uygulanması
6. Hafta - Teorik
iPBS, SCAR markör tekniği
6. Hafta - Laboratuvar
iPBS, SCAR tekniğinin uygulanması
7. Hafta - Teorik
Protein analiz metotları (Ara Sınav)
8. Hafta - Teorik
Çekirdek DNA gen bölgeleri
8. Hafta - Laboratuvar
PCR ile nrDNA gen bölgesinin amplifikasyonu
9. Hafta - Teorik
Kloroplast DNA (trnL-F, rbcL, matK, ndhF, trnQ-rps16 vb.) gen bölgeleri
9. Hafta - Laboratuvar
Kloroplast DNA (trnL-F, rbcL, matK, ndhF, trnQ-rps16 vb.) gen bölgelerinin PCR ile amplifikasyonu
10. Hafta - Teorik
Mitokondri gen bölgeleri
10. Hafta - Laboratuvar
Mitokondri gen bölgeleri gen bölgelerinin PCR ile amplifikasyonu
11. Hafta - Teorik
Bakteri ve Fungus gen bölgeleri
11. Hafta - Laboratuvar
Bakteri ve Fungus gen bölgelerinin PCR ile amplifikasyonu
12. Hafta - Teorik
DNA sekans analizi
12. Hafta - Laboratuvar
NCBI, Blast, BioEdit, FinchTV, MEGA, Sequencher 5.4.6 gibi biyoinformatik programlarım öğretilmesi
13. Hafta - Teorik
Filogenetik analiz metotları
13. Hafta - Laboratuvar
Biyoinformatik araçlar ile filogenetik ağaç oluşturma
14. Hafta - Teorik
Filogenetik analiz metotları
14. Hafta - Laboratuvar
Gen bölgelerinin NCBI ya yüklenmesi ve erişim numarası alınması
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Laboratuvar1%5
Kısa Sınav (Quiz)1%5
Ara Sınav (Vize)1%30
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%60
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders142142
Laboratuvar141242
Ara Sınav1718
Dönem Sonu Sınavı1718
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)100
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
PÇ-11
OÇ-1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
OÇ-2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
OÇ-3
1
1
1
1
1
OÇ-4
1
1
OÇ-5
1
1
OÇ-6
1
1
OÇ-7
2
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026