Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Uygulamalı Moleküler Biyoloji II
Ders Kodu: TBY304
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 0
Kredi: 3
Laboratuvar: 2
AKTS: 4
Amaç

Ökaryot ve prokaryotlarda gen anlatım mekanizmalarının öğretilmesi

Özet İçerik

Prokaryot ve ökaryotlarda gen anlatımı; transkripsiyon, transkripsiyonu düzenleyen faktörler, mRNA’nın işlenmesi, genetik kod, translasyon ve translasyon sonrası modifikasyonlarla işlevsel protein üretimi

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Dersin sonunda öğrenciler Transkripsiyon, gen regülasyonu, RNA işlenmesi, ve translasyonun mekanizmasını bilirler
2.Genomik ve fonksiyonel genomikteki gelişmelerin bakış açımızı nasıl geliştirdiğini anlayabilirler
3.Moleküler bilgilerini HIV retrovirüs ve insan hastalık durumlarının altında yatan bozuklukları gibi kompleks mekanizmaları anlamak ve bu konuda hipotez oluşturmak için kullanabilirler
4.Gel shift, nuclear run-on ölçümleri, promotor linker tarama, analizi gibi standart moleküler tekniklerin kullanıldığı deney sonuçlarını yorumlayabilirler
5.Klasik deneylerin, DNA replikasyonunu, rekombinasyonunu, transkripsiyonu ve gen regulasyonunu anlamada nasıl katkıda bulunduğunu açıklayabilirler
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Moleküler Biyoloji (Protein Sentezi ve Yıkımı). Ed: Ahmet Yıldırım, Fevzi Bardakçı, Mehmet Karataş, Bahattin Tanyolaç. NOBEL Kitabevi
2.Moleküler Biyoloji. Nihat Dilsiz. Palme Yayıncılık.
3.Genes VIII, Benjamin Lewin, New Jersey: Prentice- Hall, 2004
4.Molecular Biology of the Gene, James D. Watson, Tania A. Baker, Stephen P. Bell , Alexander Gann , Michael Levine , Richard Losick, Benjamin Cummings Pub Co., San Francisco, 2003.
5.Tarımsal Genetik, 2005, Ahmet OKUMUŞ, OMÜ Ziraat Fakültesi ders notları.Samsun
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik
Prokaryotlarda gen anlatımı
1. Hafta - Laboratuvar
Moleküler biyoloji laboratuvarının tanıtılması
1. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
2. Hafta - Teorik
Ökaryotlarda gen anlatımı
2. Hafta - Laboratuvar
Moleküler işaretleyiciler
2. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
3. Hafta - Teorik
Prokaryotlarda temel transkripsiyon mekanizmasının oluşumu, farklı uyaranlarla aktivasyon ve baskılama, transkripsiyon faktörleri
3. Hafta - Laboratuvar
DNA izolasyonu ve PCR'da çoğaltma
3. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
4. Hafta - Teorik
Prokaryotlarda temel transkripsiyon mekanizmasının oluşumu, farklı uyaranlarla aktivasyon ve baskılama, transkripsiyon faktörleri
4. Hafta - Laboratuvar
PCR ürünün jelde yürütülmesi ve sonrasındaki işlemler
4. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
5. Hafta - Teorik
Ökaryotlarda temel transkripsiyon mekanizmasının oluşumu, farklı uyaranlarla aktivasyon ve baskılama, transkripsiyon faktörleri
5. Hafta - Laboratuvar
western blot, northern blot Southern Blot analizi
5. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
6. Hafta - Teorik
Ökaryotlarda temel transkripsiyon mekanizmasının oluşumu
6. Hafta - Laboratuvar
RNA izolasyonu
6. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
7. Hafta - Teorik
RNA'nın işlenmesi
7. Hafta - Laboratuvar
cDNA kütüphanesinin hazırlanması
7. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
8. Hafta - Teorik
cDNA kütüphanesinin hazırlanması (Ara sınav)
9. Hafta - Teorik
mRNA Stabilitesi ve Lokalizasyonu
9. Hafta - Laboratuvar
Gerçek zamanlı PCR
9. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
10. Hafta - Teorik
DNA metilasyonu
10. Hafta - Laboratuvar
Gradyan PCR analizleri
10. Hafta - Ön Hazırlık
Genomik damgalama
11. Hafta - Teorik
Genetik kod
11. Hafta - Laboratuvar
DNA dizi analizi
11. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
12. Hafta - Teorik
Yeni nesil DNA dizileme
12. Hafta - Laboratuvar
Yeni nesil DNA dizileme
12. Hafta - Ön Hazırlık
Yeni nesil DNA dizileme
13. Hafta - Teorik
Ökaryotlarda translasyon, tRNA, ribozomlar ve düzenleyici proteinlerin yapı ve fonksiyonları
13. Hafta - Laboratuvar
Western Blot ve zimogram
13. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
14. Hafta - Teorik
Translasyonun ardından işlevsel bir protein oluşması için gerekli işlemler
14. Hafta - Laboratuvar
Translasyon sonrası modifikasyonlar
14. Hafta - Ön Hazırlık
Ders Kitapları ve internet kaynaklarından slayt hazırlığı
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Laboratuvar1%5
Kısa Sınav (Quiz)1%5
Ara Sınav (Vize)1%30
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%60
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders142256
Uygulamalı Ders42840
Ara Sınav1213
Dönem Sonu Sınavı1213
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)102
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
PÇ-11
OÇ-1
1
1
2
3
1
OÇ-2
1
2
2
2
OÇ-3
1
3
2
1
1
OÇ-4
1
2
3
3
3
2
OÇ-5
1
1
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026