Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
Biyoinformatiğe Giriş
Ders Kodu: BİS529
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Yüksek Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 2
Uyg.: 0
Kredi: 2
Laboratuvar: 0
AKTS: 2
Amaç

Dersin amacı Biyoistatistik ve Medikal İnformatik Yüksek Lisans öğrencilerine informatik uygulamaların moleküler biyoloji boyutu ile ilgili teorik ve pratik kavramları aktarmaktır. Bu ders ile öğrencilerin veri bankalarındaki çok miktardaki verilerin analizlerine yaklaşımlar sağlamaları amaçlanmıştır.

Özet İçerik

Biyoinformatiğin tanımı ve temel kavramları. Moleküler biyoloji veri tabanları, makromoleküler dizilerin analizi, genom takımı ve gelecek nesil dizileri, protein-protein etkileşimi ve ağlar, filogenetik, protein yapısı ve tahmini, moleküler dinamikler, genetik bağlanım, gen ekspresyon.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Biyoinformatiğin sağlık sektöründeki yeri ve önemini bilme, kavrama
2.Biyolojik veri tabanlarının temellerini anlama ve moleküler biyoloji ve genetik kapsamında kullanılabilme
3.İki veya daha fazla dizi için karşılaştırma araçlarının tanımlanabilmesi ve benzerlik/uyumsuzluk durumunun tartışılabilmesi
4.Protein-RNA ve DNA arasındaki bilgi akışını anlayabilme ve büyük ölçekli biyolojik verilerin çeşitli biyoinformatik temelli araçlar kullanarak analiz edebilme
5.Biyoinformatik araçları kullanarak genomik, proteomik ve farmakogenetik yaklaşımları tartışılabilme
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Claverie, J. M., & Notredame, C. (2006). Bioinformatics for dummies. John Wiley & Sons.
2.Baxevanis, A. D., & Ouellette, B. F. (2004). Bioinformatics: a practical guide to the analysis of genes and proteins (Vol. 43). John Wiley & Sons.
3.Zvelebil, M. J., & Baum, J. O. (2007). Understanding bioinformatics. Garland Science.
4.Rashidi, H. H., & Buehler, L. K. (1999). Bioinformatics basics: applications in biological science and medicine. CRC press.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik
Derse giriş: DNA veri tabanları
2. Hafta - Teorik
Protein veri tabanları
3. Hafta - Teorik
DNA Dizilimi ve Takımı
4. Hafta - Teorik
Translasyon, haritalama ve primerler
5. Hafta - Teorik
Protein yapısı Web araçları
6. Hafta - Teorik
İkili karşılaştırma puanlama matrisleri
7. Hafta - Teorik
Veri tabanlarının benzerliğini araştırma
8. Hafta - Teorik
Literatür tarama ve tartışma (Ara sınav)
9. Hafta - Teorik
Çoklu hizalama
10. Hafta - Teorik
Motifler, desenler, profiller
11. Hafta - Teorik
Genombilim - genomlar nasıl dizilenmiştir? Genom Veritabanları ve UCSC Tarayıcı
12. Hafta - Teorik
Genom tarayıcısı 2 Karşılaştırmalı Genombilimi
13. Hafta - Teorik
Gen Listesi ile çalışmak: Gen Ontolojisi
14. Hafta - Teorik
Poligenetik analize giriş
15. Hafta - Dönem Sonu Sınavı (Final)
Final sınavı
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Derse Katılım (Performans)1%5
Ödev1%5
Ara Sınav (Vize)1%20
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders140228
Ara Sınav110111
Dönem Sonu Sınavı115217
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)56
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
OÇ-1
5
3
3
3
4
3
4
3
3
3
OÇ-2
5
5
5
3
4
5
4
4
5
4
OÇ-3
OÇ-4
OÇ-5
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026