Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
İstatistiksel Genetik
Ders Kodu: BİS536
Ders Türü: Seçmeli
Ders Grubu: Yüksek Lisans
Eğitim Dili: Türkçe
Staj Durumu: Yok
Teori: 3
Uyg.: 0
Kredi: 3
Laboratuvar: 0
AKTS: 3
Amaç

Bu ders çok az Genetik bilgisi olan fakat Olasılık ve İstatistik hakkında bazı bilgilere sahip öğrenciler için model ve İstatistiksel Genetik yöntemlerine bir giriştir. Bu ders İstatistiksel Genetik alanında daha fazla çalışma için bir temel sağlar.

Özet İçerik

Mendel genetik denemeleri, Hardy-Weinberg, allel değişkenliği, alt bölünmeler, olabilirlik çıkarsamaları, gizli değişkenler ve EM algoritması, soyağacı ve gen kimliği, Meiosis ve rekombinasyon, bağlantı ve çok noktalı bağlantı analizi.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
1.Bir nicel özelliğe genetik ve çevresel etkileri istatistiksel olarak ilişkilendirebilme
2.Genetik ve çevresel etkilerin tahmini için işlemleri tespit edebilme
3.Kantitatif özelliklerin değişimini etkileyen genlerin lokalizasyonu için yöntemler tespit edebilmek
4.Kantitatif özelliklerde genetik varyantların etkilerini ölçmek için yöntemler tespit edebilme
5.Kantitatif özelliklerin genetik etkilerini içeren mevcut uygulamalı ve teorik literatürü okuyabilme/anlayabilme
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1.Lange, K. (2003). Mathematical and statistical methods for genetic analysis. Springer Science & Business Media.
2.Weir, B. S. (1990). Genetic data analysis. Methods for discrete population genetic data. Sinauer Associates, Inc. Publishers.
3.Thompson, E. A. (2000). Statistical inference from genetic data on pedigrees. IMS.
4.Balding, D. J., Bishop, M., & Cannings, C. (Eds.). (2008). Handbook of statistical genetics. John Wiley & Sons.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
1. Hafta - Teorik
Genom haritalamaya genel bakış
2. Hafta - Teorik
Temel genetik: Mendel genetiği, Nüfus ve kantitatif genetik, Marker segregasyon analizi
3. Hafta - Teorik
Temel Mendel özellikleri; Mendel ayrımcılık, dominant ve resesif özellikler, X'e bağlı özellikleri, kalıtım kalıpları
4. Hafta - Teorik
Nüfus genetik sorunları, Hardy-Weinberg dengesini test etme, allel frekanslarının olabilirlik kestirimi, EM algoritması
5. Hafta - Teorik
Haplotipler, allel birliği ve haplotyping. Haplotip frekansları olabilirlik kestirimi. Mutasyon, seçilim ve rasgele genetik sürüklenme
6. Hafta - Teorik
Akrabalık, soy tarafından gen kimliği, soy ağacı ile ilgili olasılıkları
7. Hafta - Teorik
Genetik bağlantı, mayoz bölünme ve rekombinasyon, 2-lokus akrabalık ve gen kimlik, bağlantı dengesizliği, İki lokus bağlantı analizi, mayoz desen olasılıkları-1
8. Hafta - Teorik
Literatür tarama ve tartışma (Ara sınav)
9. Hafta - Teorik
Genetik bağlantı, mayoz bölünme ve rekombinasyon, 2-lokus akrabalık ve gen kimlik, bağlantı dengesizliği, İki lokus bağlantı analizi, mayoz desen olasılıkları-2
10. Hafta - Teorik
Iki lokus bağlantı için basit tasarımlar, bağlantı için test, beklenen lod puanları ve bağlantı belirleme gücü, homozigosite haritalama-1
11. Hafta - Teorik
Iki lokus bağlantı için basit tasarımlar, bağlantı için test, beklenen lod puanları ve bağlantı belirleme gücü, homozigosite haritalama-2
12. Hafta - Teorik
Mayoz, rekombinasyon ve harita fonksiyonları
13. Hafta - Teorik
Çoklu bağlantı analizi, çoklu bağlantı için gizli Markov modeli
14. Hafta - Teorik
Baum algoritmaları; harita tahmini için EM algoritması
15. Hafta - Dönem Sonu Sınavı (Final)
Final sınavı
Değerlendirme
Değerlendirme TürüAdetYüzde
Derse Katılım (Performans)1%5
Ödev1%5
Ara Sınav (Vize)1%20
Dönem Sonu Sınavı (Final)1%70
İş Yükü Hesaplaması
EtkinlikSayısıÖn HazırlıkSüreToplam Iş Yükü (Saat)
Kuramsal Ders140228
Ödev1202
Kısa Sınav2216
Ara Sınav115217
Dönem Sonu Sınavı120222
TOPLAM İŞ YÜKÜ (Saat)75
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
PÇ-1
PÇ-2
PÇ-3
PÇ-4
PÇ-5
PÇ-6
PÇ-7
PÇ-8
PÇ-9
PÇ-10
OÇ-1
5
5
5
5
5
5
4
5
5
5
OÇ-2
5
5
4
5
5
5
5
5
5
4
OÇ-3
4
5
5
5
4
4
4
4
4
3
OÇ-4
5
3
4
5
4
5
4
5
3
4
OÇ-5
5
4
5
4
5
4
5
4
5
4
Adnan Menderes Üniversitesi - Bilgi Paketi / Ders Kataloğu
2026